23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1157 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.26 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.81 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  30.74 
 
 		 267 aa  135  5e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  31.13 
 
 		 269 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 262 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  34.63 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  30 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  30.35 
 
 		 266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.86 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  30.86 
 
 		 258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  30.5 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  29.57 
 
 		 259 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  30.52 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  28.12 
 
 		 263 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  28.51 
 
 		 269 aa  98.2  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  28.92 
 
 		 269 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  30.95 
 
 		 262 aa  92.8  5e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.31 
 
 		 269 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  25.68 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  27.84 
 
 		 268 aa  86.3  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  25.3 
 
 		 267 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>