40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0223 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  64.37 
 
 		 266 aa  353  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  62.98 
 
 		 269 aa  351  5e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  62.6 
 
 		 269 aa  351  8e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  62.98 
 
 		 269 aa  349  3e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  35.83 
 
 		 269 aa  167  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  35.57 
 
 		 267 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  35.69 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.2 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  32.81 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  32.94 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  31.62 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.91 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  33.99 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  29.64 
 
 		 259 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  29.92 
 
 		 268 aa  129  7.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  29.18 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.67 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  32.67 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  32.27 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.56 
 
 		 261 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3790  ArsR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 117 aa  49.3  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  37.36 
 
 		 382 aa  47.4  0.0002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  46.34 
 
 		 380 aa  45.8  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  44.83 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  47.27 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  44.83 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  44.83 
 
 		 362 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  44.83 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  44.83 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  44.83 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  44.83 
 
 		 362 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  45.45 
 
 		 363 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  44.83 
 
 		 362 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  45.83 
 
 		 363 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  43.64 
 
 		 374 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 		 360 aa  42.4  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  42.86 
 
 		 321 aa  42  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>