More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1913 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1913  PfkB domain protein  100 
 
 		 363 aa  712    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.154738  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1445  ribokinase-like domain-containing protein  42.22 
 
 		 363 aa  315  6e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2725  ribokinase-like domain-containing protein  43.61 
 
 		 363 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2951  ribokinase-like domain-containing protein  43.61 
 
 		 363 aa  308  6.999999999999999e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1351  ribokinase-like domain-containing protein  42.66 
 
 		 374 aa  300  2e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.759267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0139  transcriptional regulator, MarR family  41.57 
 
 		 360 aa  290  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0258  ribokinase-like domain-containing protein  40.5 
 
 		 380 aa  288  8e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0555  PfkB domain protein  43.52 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1032  ribokinase-like domain-containing protein  40.66 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000268353  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1461  kinase yeiC, putative  39.29 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0117652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1733  PfkB family kinase  38.64 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000174723  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  33.63 
 
 		 362 aa  228  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  33.33 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  227  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  33.04 
 
 		 362 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02095  predicted kinase  35.76 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.308891  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2303  hypothetical protein  35.76 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0379956  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02054  hypothetical protein  35.76 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1482  hypothetical protein  35.76 
 
 		 313 aa  215  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0391896  hitchhiker  0.00000306075 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1492  PfkB domain protein  35.76 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.104134  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2313  hypothetical protein  35.76 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0218939  decreased coverage  0.000211753 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2463  hypothetical protein  35.76 
 
 		 313 aa  214  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0259659  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3302  hypothetical protein  35.43 
 
 		 313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0135155  normal  0.0377447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4622  ribokinase-like domain-containing protein  31.18 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0428968  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0301  ribokinase-like domain-containing protein  33.88 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0294  ribokinase-like domain-containing protein  33.88 
 
 		 372 aa  197  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  30.16 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0358  PfkB  30.43 
 
 		 377 aa  181  2.9999999999999997e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.660775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0663  PfkB domain protein  34.85 
 
 		 315 aa  175  9e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3467  ribokinase-like domain-containing protein  29.24 
 
 		 312 aa  157  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3222  ribokinase-like domain-containing protein  26.33 
 
 		 314 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.830633  normal  0.0230782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3923  ribokinase-like domain-containing protein  26.1 
 
 		 314 aa  144  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0899  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2164  PfkB domain protein  29.04 
 
 		 313 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1959  PfkB domain protein  26.85 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1980  ribokinase  26.46 
 
 		 302 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1264  hypothetical protein  24.86 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2559  carbohydrate kinase  24.67 
 
 		 321 aa  106  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.270626  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  25.81 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  25.48 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.24 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4234  ribokinase  27.57 
 
 		 308 aa  100  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000102528  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2170  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 314 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.68008  normal  0.0885177 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4524  ribokinase  27.57 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00216955  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  26.48 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  26.48 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  26.48 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03638  ribokinase  27 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00223583  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4215  ribokinase  28.57 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4171  ribokinase  27.62 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000241058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  25.77 
 
 		 306 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4120  ribokinase  28.25 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.444588  normal  0.199768 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03583  hypothetical protein  27 
 
 		 309 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00147711  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  28.77 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  27.31 
 
 		 309 aa  97.4  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4242  ribokinase  27.8 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.459204  hitchhiker  0.00710658 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3968  ribokinase  27.8 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.112559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4268  ribokinase  27.8 
 
 		 309 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00050994  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4167  ribokinase  27.8 
 
 		 309 aa  97.1  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.895072  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5188  ribokinase  27.8 
 
 		 314 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.034479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.44 
 
 		 305 aa  95.1  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  26.57 
 
 		 307 aa  94.4  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  24.83 
 
 		 302 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3974  ribokinase  27.42 
 
 		 308 aa  93.2  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00187599  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  25.52 
 
 		 302 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0354  ribokinase  27.5 
 
 		 308 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4097  ribokinase  26.91 
 
 		 309 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  24.48 
 
 		 302 aa  90.1  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  26.91 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  26.91 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  26.91 
 
 		 309 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1923  ribokinase  26.22 
 
 		 305 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.254632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  22.98 
 
 		 308 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1960  ribokinase  24.09 
 
 		 302 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.0586965 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  26.07 
 
 		 305 aa  88.6  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  25.6 
 
 		 305 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  26.46 
 
 		 309 aa  87.8  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  22.8 
 
 		 308 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3350  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  87  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.373497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  26.87 
 
 		 305 aa  86.7  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4897  ribokinase  27.16 
 
 		 318 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00647815  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2649  ribokinase  25 
 
 		 319 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000212257  normal  0.357458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17480  sugar kinase, ribokinase  23.99 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.402042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2100  ribokinase  27.84 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1507  ribokinase  22.83 
 
 		 308 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  22.66 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1526  ribokinase  22.83 
 
 		 308 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.395922  normal  0.909431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1013  putative ribokinase protein  22.8 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.340196  normal  0.195927 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4112  ribokinase  28.03 
 
 		 314 aa  80.5  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.137764  normal  0.0163752 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  22.8 
 
 		 295 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1312  ribokinase  25.52 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0404  ribokinase  27.27 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000422627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3477  ribokinase  24.81 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1233  ribokinase  22.84 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.567948  normal  0.0906963 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3470  ribokinase  24.03 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.973567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  24.31 
 
 		 329 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>