23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1499 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 258 aa  518  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  94.96 
 
 		 258 aa  500  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  42.47 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  42.19 
 
 		 269 aa  211  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.77 
 
 		 264 aa  206  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 262 aa  205  5e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  37.45 
 
 		 266 aa  183  3e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  39.45 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  38.28 
 
 		 267 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  38.22 
 
 		 269 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  39.06 
 
 		 259 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  38.04 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  34.77 
 
 		 259 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  32.81 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  34.65 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  28.29 
 
 		 269 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  31.3 
 
 		 261 aa  113  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  28.85 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.6 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.67 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  29.15 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>