23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2036 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  527  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  67.18 
 
 		 262 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  61.45 
 
 		 264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  48.65 
 
 		 269 aa  265  4e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  48.44 
 
 		 267 aa  263  3e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  48.44 
 
 		 269 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  50 
 
 		 269 aa  256  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  45.8 
 
 		 266 aa  245  4.9999999999999997e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  45.53 
 
 		 263 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  42.47 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  42.47 
 
 		 258 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  42.08 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  38.52 
 
 		 259 aa  208  8e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 259 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  43.67 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  36.22 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  30.83 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  32.94 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  30.2 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  30.2 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  35.14 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  28.46 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  34.24 
 
 		 261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>