32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0541 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 269 aa  550  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  90.33 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  89.93 
 
 		 269 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  78.41 
 
 		 266 aa  435  1e-121  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  62.6 
 
 		 262 aa  340  2e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 262 aa  142  7e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  30.2 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  32.67 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  32.54 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.25 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.46 
 
 		 264 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  32.67 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  30.28 
 
 		 263 aa  135  7.000000000000001e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  31.87 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  28.06 
 
 		 259 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  30.2 
 
 		 267 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  29.96 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.6 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  29.6 
 
 		 258 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  28.8 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 254 aa  92.8  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.31 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2296  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02048  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0826049  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3296  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.170772  normal  0.250376 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0806  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2307  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.945779  hitchhiker  0.00150581 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1488  hypothetical protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000467798  hitchhiker  0.00751025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02089  predicted kinase  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.114091  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1498  PfkB domain protein  40 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282324  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0317  kinase, PfkB family  40 
 
 		 382 aa  43.9  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.196123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>