26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1233 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1233  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2036  hypothetical protein  61.45 
 
 		 262 aa  336  1.9999999999999998e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.286499  normal  0.372572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1359  Crp/FNR family transcriptional regulator  54.58 
 
 		 262 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.036138  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0419  regulatory protein, MarR  52.14 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2244  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  52.33 
 
 		 269 aa  267  1e-70  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0183  regulatory protein Crp  51.16 
 
 		 269 aa  259  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.422757  normal  0.155154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2502  regulatory protein, Crp  48.84 
 
 		 267 aa  253  3e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.581333  normal  0.255319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1576  hypothetical protein  46.15 
 
 		 266 aa  249  5e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0237747 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0976  regulatory protein, ArsR  47.67 
 
 		 263 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.262232  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1289  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  40.77 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1499  hypothetical protein  40.77 
 
 		 258 aa  206  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.29326  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1274  hypothetical protein  39.23 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0378211  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2506  regulatory protein IclR  39.38 
 
 		 259 aa  196  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1308  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 		 259 aa  176  5e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2797  transcriptional regulator, MarR family  45.02 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2060  regulatory protein Crp  35.16 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0023  regulatory protein Crp  37.6 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.780112  normal  0.0232711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1606  regulatory protein Crp  30.38 
 
 		 269 aa  149  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.296592  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0375  regulatory protein Crp  29.53 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0306  regulatory protein Crp  29.53 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0541  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  29.46 
 
 		 269 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1157  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  33.86 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0223  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  31.91 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6307  protein of unknown function DUF1612  44.62 
 
 		 374 aa  45.4  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.396537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5470  protein of unknown function DUF1612  45.9 
 
 		 363 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.480823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  29.47 
 
 		 153 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>