231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4423 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  100 
 
 
153 aa  307  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  77.37 
 
 
171 aa  209  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  74.83 
 
 
153 aa  205  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  72.19 
 
 
166 aa  204  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  72.19 
 
 
166 aa  204  4e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  76.69 
 
 
153 aa  200  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  77.44 
 
 
163 aa  200  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  66.67 
 
 
155 aa  187  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  64.05 
 
 
164 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  70.15 
 
 
164 aa  180  6e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  67.16 
 
 
156 aa  179  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  64.08 
 
 
157 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  64.08 
 
 
157 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  64.08 
 
 
157 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  63.95 
 
 
163 aa  179  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  64.08 
 
 
157 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  64.75 
 
 
152 aa  179  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  64.08 
 
 
157 aa  179  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  61.49 
 
 
155 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  61.49 
 
 
155 aa  177  7e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  60.99 
 
 
157 aa  170  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  63.97 
 
 
170 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  48.68 
 
 
149 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  54.2 
 
 
152 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  54.2 
 
 
152 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1915  manganese transport regulator MntR  48.51 
 
 
156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00170642  decreased coverage  0.00000058092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  52.76 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  50.79 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  47.02 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1686  manganese transport regulator MntR  48.51 
 
 
159 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.187072 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  39.17 
 
 
154 aa  97.4  5e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  36.13 
 
 
163 aa  96.7  1e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  41.96 
 
 
143 aa  94.7  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  35.94 
 
 
160 aa  92.4  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  36.84 
 
 
163 aa  86.3  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.07 
 
 
160 aa  85.5  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84  8e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84  8e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84  8e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84  8e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84  8e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  42.24 
 
 
140 aa  83.6  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  84  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
141 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  37.84 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  39.62 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.18 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  40.57 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  35.14 
 
 
160 aa  80.9  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.05 
 
 
121 aa  80.1  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.63 
 
 
125 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  35.34 
 
 
159 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.17 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  34.86 
 
 
156 aa  74.7  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  32.82 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  38.1 
 
 
159 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.4 
 
 
231 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  33.05 
 
 
226 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  36.28 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  36.45 
 
 
147 aa  70.1  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  33.33 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  32.17 
 
 
137 aa  70.1  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.52 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  34.29 
 
 
159 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 
121 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.09 
 
 
144 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  31.25 
 
 
130 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.26 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  35.71 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1487  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 
176 aa  67  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.78 
 
 
221 aa  67  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  35.71 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.14 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  33.04 
 
 
172 aa  65.5  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.48 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  33.88 
 
 
227 aa  63.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  30.51 
 
 
157 aa  62.8  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  35.29 
 
 
390 aa  62.8  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.12 
 
 
218 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  31.58 
 
 
217 aa  62.4  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  35.71 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  32.46 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  31.58 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  32.46 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
172 aa  62  0.000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  38.05 
 
 
177 aa  62  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  32.46 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  38.26 
 
 
227 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>