293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1669 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 239 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.17 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  32.48 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.06 
 
 		 237 aa  122  7e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  31.91 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.05 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  41.67 
 
 		 148 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  31.47 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  31.3 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.79 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.81 
 
 		 235 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.49 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.06 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.05 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  47.58 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.07 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  41.35 
 
 		 134 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  32.17 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  41.35 
 
 		 134 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  29.49 
 
 		 224 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  41.35 
 
 		 134 aa  107  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.92 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  29.49 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  30.67 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.16 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.36 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  32.9 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.35 
 
 		 168 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  41.98 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.17 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  36.63 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  29.26 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  29.07 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.26 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.81 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  29.36 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.97 
 
 		 236 aa  99.8  4e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.04 
 
 		 176 aa  99.4  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.98 
 
 		 233 aa  97.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.15 
 
 		 220 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.87 
 
 		 241 aa  96.7  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  29.36 
 
 		 234 aa  96.3  4e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  40.83 
 
 		 225 aa  95.9  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.3 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.05 
 
 		 227 aa  95.9  6e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  30.67 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  34 
 
 		 234 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  27.19 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.17 
 
 		 232 aa  95.1  8e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  40.3 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.17 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  38.35 
 
 		 237 aa  94.7  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.47 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.6 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  33.5 
 
 		 236 aa  93.6  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  30.17 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.6 
 
 		 234 aa  94  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.8 
 
 		 239 aa  94  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.66 
 
 		 233 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.2 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  32.68 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  32.48 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  32.83 
 
 		 251 aa  92.8  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.89 
 
 		 236 aa  92.8  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.84 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  43.36 
 
 		 139 aa  91.7  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  26.55 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.41 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.12 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  38.64 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  37.67 
 
 		 177 aa  89.4  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  33.16 
 
 		 214 aa  89.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  40.62 
 
 		 140 aa  89.7  4e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.54 
 
 		 217 aa  89.4  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  28.45 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.85 
 
 		 214 aa  89  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 248 aa  88.6  9e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  30.87 
 
 		 232 aa  88.2  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  29.33 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.59 
 
 		 237 aa  88.2  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  32.24 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.73 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  34 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  30.5 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  30.5 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  30.5 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.1 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.35 
 
 		 238 aa  86.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  38.35 
 
 		 228 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  25.88 
 
 		 213 aa  86.7  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.57 
 
 		 214 aa  86.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.84 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  32.14 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.84 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>