235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2346 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  100 
 
 		 142 aa  289  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  90.07 
 
 		 141 aa  263  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  89.78 
 
 		 142 aa  253  6e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  87.05 
 
 		 142 aa  253  7e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  87.05 
 
 		 142 aa  253  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  87.05 
 
 		 142 aa  253  7e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  87.05 
 
 		 142 aa  253  7e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  87.05 
 
 		 142 aa  253  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  87.05 
 
 		 142 aa  253  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  87.05 
 
 		 142 aa  253  7e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  85.61 
 
 		 142 aa  250  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  85.61 
 
 		 142 aa  250  6e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  84.89 
 
 		 142 aa  248  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  54.23 
 
 		 143 aa  157  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.6 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1404  manganese transport transcriptional regulator  43.45 
 
 		 157 aa  120  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2802  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.9 
 
 		 172 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1402  DtxR family iron dependent repressor  41.98 
 
 		 159 aa  110  4.0000000000000004e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000267968  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  44.26 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  44.26 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  44.36 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  40.15 
 
 		 154 aa  106  1e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0029  iron dependent repressor  39.13 
 
 		 167 aa  102  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  36.88 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  34.03 
 
 		 163 aa  94  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2721  iron dependent repressor  36.29 
 
 		 144 aa  94  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.102703  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  35.04 
 
 		 159 aa  91.7  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.94 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  39.5 
 
 		 142 aa  90.5  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0867  manganese transport regulator MntR  37.82 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.79 
 
 		 121 aa  89.7  1e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0973  iron dependent repressor  38.1 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.106771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  36.92 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  39.37 
 
 		 160 aa  88.6  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  35 
 
 		 140 aa  87.8  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2411  iron dependent repressor  37.3 
 
 		 156 aa  86.7  9e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0854  hypothetical protein  40.54 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.513797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  39.62 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  39.62 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  39.62 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  40.59 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  39.6 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  39.05 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  39.62 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3611  DtxR family iron dependent repressor  40 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3949  DtxR family iron dependent repressor  40 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.592113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0301  manganese transport regulator MntR  38.61 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0279959  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1313  iron dependent repressor  35.94 
 
 		 145 aa  80.1  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.244265  normal  0.0126962 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0329  manganese transport regulator MntR  37.62 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.930858  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  39.64 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.14 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  38.68 
 
 		 163 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1583  transcriptional regulator LysR family  39.05 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.104279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.68 
 
 		 153 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  30.65 
 
 		 225 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00784  DNA-binding transcriptional regulator of mntH  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00801  hypothetical protein  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1346  histidine kinase  36.21 
 
 		 390 aa  76.3  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0129942  normal  0.400624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  40.59 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0874  manganese transport regulator MntR  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0887  manganese transport regulator MntR  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.185812  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2826  manganese transport regulator MntR  37.74 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.876091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  36.79 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  36.79 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  36.79 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  36.79 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1304  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.581866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  36.79 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  34.96 
 
 		 230 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  33.57 
 
 		 221 aa  73.9  0.0000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.03 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.54 
 
 		 227 aa  73.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.96 
 
 		 237 aa  74.3  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 239 aa  73.6  0.0000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  35.19 
 
 		 170 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.71 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  30.94 
 
 		 238 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32.52 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.54 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  30.95 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  34.65 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  30.95 
 
 		 134 aa  70.9  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.8 
 
 		 232 aa  70.5  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.95 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.6 
 
 		 240 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.01 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  38.26 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.23 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0783  iron dependent repressor  45.59 
 
 		 72 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  34.11 
 
 		 218 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0438  iron dependent repressor  37.07 
 
 		 138 aa  67.8  0.00000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.23 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>