271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1871 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  46.88 
 
 		 221 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.47 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  37.38 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  32.72 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.22 
 
 		 237 aa  99.4  4e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.38 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.31 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  34.29 
 
 		 148 aa  90.5  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.09 
 
 		 229 aa  89.7  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  32.57 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  31.13 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  33.09 
 
 		 134 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 240 aa  89  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  33.09 
 
 		 134 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  32.35 
 
 		 134 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  31.63 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.41 
 
 		 231 aa  88.2  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  31.63 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  31.63 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  31.16 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  31.34 
 
 		 229 aa  86.7  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  28.57 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  31.94 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  29.36 
 
 		 210 aa  87  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  36.25 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  26.32 
 
 		 238 aa  86.3  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.38 
 
 		 251 aa  85.5  6e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.8 
 
 		 229 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  31.94 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.98 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.05 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.17 
 
 		 248 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.08 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.6 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.68 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  31.92 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  30.19 
 
 		 227 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.56 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  35 
 
 		 127 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.84 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  38.05 
 
 		 152 aa  79.3  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.47 
 
 		 240 aa  79.3  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  29.18 
 
 		 236 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.7 
 
 		 234 aa  79  0.00000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  28.38 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  32.24 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  29.82 
 
 		 241 aa  78.2  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.17 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.98 
 
 		 238 aa  78.2  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  29.58 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  30.23 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.58 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  30.81 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  35.48 
 
 		 217 aa  76.6  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0388  iron dependent repressor  33.09 
 
 		 125 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.180096  normal  0.327161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.32 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.14 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1105  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.61 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000518249  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  34.75 
 
 		 163 aa  75.5  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  28.12 
 
 		 255 aa  75.5  0.0000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  30.05 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.7 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  37.86 
 
 		 153 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  35.09 
 
 		 155 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.48 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  30.05 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.39 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  32.09 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  36.54 
 
 		 156 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.86 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.7 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  25.12 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  38.18 
 
 		 160 aa  73.6  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.23 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.3 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  28.71 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.79 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  30.18 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  25.84 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  35.4 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  35.4 
 
 		 171 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.06 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  35.4 
 
 		 166 aa  72.4  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.76 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  35.43 
 
 		 222 aa  71.6  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  28.11 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.61 
 
 		 146 aa  71.2  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1353  manganese transport regulator MntR  37.25 
 
 		 170 aa  70.9  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.895463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2825  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  31.3 
 
 		 154 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0841  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.515904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0966  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0782983  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4423  manganese transport regulator MntR  33.05 
 
 		 153 aa  70.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2531  manganese transport regulator MntR  37.5 
 
 		 155 aa  70.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>