198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_27510 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 231 aa  462  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  76.19 
 
 		 230 aa  352  2e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.93 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.92 
 
 		 229 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  64.32 
 
 		 230 aa  271  8.000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  62.83 
 
 		 230 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  62.83 
 
 		 230 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  62.83 
 
 		 230 aa  269  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  64 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  68.02 
 
 		 227 aa  268  4e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  62.83 
 
 		 229 aa  264  1e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  62.83 
 
 		 229 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  59.66 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  64.85 
 
 		 234 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.91 
 
 		 233 aa  251  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  64.36 
 
 		 236 aa  248  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.35 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  62.38 
 
 		 231 aa  241  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.36 
 
 		 229 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63 
 
 		 234 aa  240  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.76 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63.55 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.08 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.38 
 
 		 228 aa  237  9e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  60.4 
 
 		 241 aa  236  1e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  60.98 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  63 
 
 		 234 aa  236  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  60.59 
 
 		 232 aa  232  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  59.62 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  61.76 
 
 		 240 aa  229  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  62.38 
 
 		 255 aa  228  6e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  57.71 
 
 		 244 aa  224  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  54.98 
 
 		 239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  51.24 
 
 		 246 aa  199  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  48.86 
 
 		 254 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.46 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  39.57 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  39.56 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.72 
 
 		 247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.96 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  31 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  42.31 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  35.42 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  32.34 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.17 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.5 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.34 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.02 
 
 		 221 aa  100  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.18 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.86 
 
 		 212 aa  94.7  1e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  30.73 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.51 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  38.93 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.67 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.67 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  31.08 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  29.61 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.77 
 
 		 221 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  36.18 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  35.05 
 
 		 222 aa  90.1  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.78 
 
 		 226 aa  89.4  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.81 
 
 		 241 aa  89.4  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  32.8 
 
 		 248 aa  89  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.32 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.88 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.55 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 		 233 aa  87.4  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.69 
 
 		 228 aa  87.4  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.18 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 237 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  35.14 
 
 		 242 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  34.25 
 
 		 230 aa  85.9  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  30.7 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.92 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.07 
 
 		 220 aa  83.6  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.36 
 
 		 239 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.97 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.66 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.72 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  34.35 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.94 
 
 		 221 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  36.84 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  28.09 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  32.82 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.81 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.35 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.14 
 
 		 236 aa  80.1  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.1 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.39 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.07 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2999  iron dependent repressor  34.11 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000263786  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.99 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>