203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0576 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 239 aa  488  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.83 
 
 		 241 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  39.89 
 
 		 240 aa  125  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  40.21 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  33.97 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.38 
 
 		 230 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.8 
 
 		 235 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  37.77 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.02 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  37.77 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  33.18 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  40.59 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  36.55 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  37.17 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.34 
 
 		 229 aa  118  7e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  37.17 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  37.17 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  37.17 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.91 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.26 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  32.24 
 
 		 223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.07 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  35.44 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  34.53 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.65 
 
 		 227 aa  111  9e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.8 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30.33 
 
 		 224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  31.71 
 
 		 237 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.94 
 
 		 240 aa  106  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  31 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  33.64 
 
 		 221 aa  105  7e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.16 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  31.79 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  31.73 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.6 
 
 		 240 aa  99  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  31.16 
 
 		 217 aa  99  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.59 
 
 		 224 aa  98.6  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  30.29 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.37 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  28.9 
 
 		 220 aa  95.9  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.24 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  28.04 
 
 		 217 aa  95.1  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.7 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.93 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  30.85 
 
 		 220 aa  93.6  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.98 
 
 		 235 aa  91.7  9e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.62 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.98 
 
 		 234 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.41 
 
 		 214 aa  91.7  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.92 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.31 
 
 		 233 aa  90.9  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  28.99 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  40.77 
 
 		 228 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  30.26 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.87 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  34.2 
 
 		 236 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.01 
 
 		 214 aa  88.2  1e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.61 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  29.05 
 
 		 310 aa  86.7  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  38.35 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  29.8 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.17 
 
 		 234 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  32.61 
 
 		 232 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.61 
 
 		 236 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.95 
 
 		 239 aa  85.1  9e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  34.95 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  36.15 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.05 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.88 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  38.52 
 
 		 236 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  31.74 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  29.58 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  38.28 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 229 aa  82  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.58 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.07 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  39.23 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.17 
 
 		 234 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  36.03 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.42 
 
 		 228 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.06 
 
 		 221 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.13 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.99 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.05 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  32.82 
 
 		 231 aa  76.6  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.35 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  30.46 
 
 		 336 aa  75.9  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  36.92 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  36.92 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  36.92 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.4 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  32.62 
 
 		 227 aa  74.7  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  33.87 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  30.09 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  29.72 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>