255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2160 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  100 
 
 		 240 aa  481  1e-135  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  69.37 
 
 		 232 aa  322  4e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  65.65 
 
 		 242 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  64.41 
 
 		 248 aa  305  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  64.76 
 
 		 240 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  64.76 
 
 		 240 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  64.76 
 
 		 240 aa  301  9e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  66.51 
 
 		 228 aa  298  3e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.29 
 
 		 226 aa  271  6e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  58.56 
 
 		 230 aa  261  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  59.52 
 
 		 251 aa  259  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  55.91 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.11 
 
 		 229 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  50.68 
 
 		 237 aa  236  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  53.42 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  50.23 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  50.23 
 
 		 238 aa  224  6e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.52 
 
 		 240 aa  220  1.9999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.78 
 
 		 233 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  45.87 
 
 		 229 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  51.02 
 
 		 227 aa  202  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  44.5 
 
 		 218 aa  186  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  42.79 
 
 		 227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  45.54 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  44.06 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.91 
 
 		 220 aa  171  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  40.7 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.98 
 
 		 227 aa  167  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  44.34 
 
 		 221 aa  167  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.67 
 
 		 216 aa  166  4e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.74 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.85 
 
 		 235 aa  164  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  42.13 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  41.74 
 
 		 226 aa  158  8e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  40.61 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  36.76 
 
 		 220 aa  152  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  37.81 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.32 
 
 		 221 aa  151  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  39.38 
 
 		 217 aa  151  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.45 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.28 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  34.1 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.81 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.44 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  35.38 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.82 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.32 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  39.35 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39 
 
 		 236 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  38.07 
 
 		 239 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.55 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.98 
 
 		 241 aa  129  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.02 
 
 		 214 aa  126  3e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.89 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  33.84 
 
 		 222 aa  122  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.5 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  33.64 
 
 		 217 aa  116  3e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.53 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.43 
 
 		 221 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  35 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  35 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.34 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.14 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.89 
 
 		 227 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  29.52 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.81 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  37.97 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.73 
 
 		 247 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  35.84 
 
 		 236 aa  99  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.77 
 
 		 161 aa  98.6  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  34.88 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  37.42 
 
 		 246 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.15 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  30.26 
 
 		 227 aa  94.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  38.3 
 
 		 255 aa  93.2  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  31.08 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  39.57 
 
 		 254 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.84 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.47 
 
 		 229 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  37.31 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  32.35 
 
 		 236 aa  89.4  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.32 
 
 		 230 aa  87.8  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.21 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.52 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.19 
 
 		 236 aa  85.5  7e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.86 
 
 		 235 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  30.43 
 
 		 230 aa  85.5  7e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.63 
 
 		 234 aa  85.5  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  34.55 
 
 		 231 aa  85.1  9e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  29.22 
 
 		 238 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  35.81 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.98 
 
 		 231 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  32.83 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  33.52 
 
 		 310 aa  82.4  0.000000000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  36.55 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  35.82 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  35.77 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  36.03 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.82 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>