229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02025 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  463  1e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  48.64 
 
 		 235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  44.29 
 
 		 220 aa  202  4e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  44.5 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.72 
 
 		 216 aa  185  6e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.2 
 
 		 221 aa  175  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  39.25 
 
 		 217 aa  171  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  38.99 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  38.53 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.12 
 
 		 232 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  39.81 
 
 		 240 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  38.43 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.32 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.85 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.65 
 
 		 228 aa  149  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.38 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  34.88 
 
 		 248 aa  148  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34.72 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34.72 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34.72 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  36.74 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  35 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.48 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 229 aa  142  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  33.96 
 
 		 227 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  38.99 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.02 
 
 		 237 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.19 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.4 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.38 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  31.65 
 
 		 229 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  38.42 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  33.84 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.65 
 
 		 238 aa  135  7.000000000000001e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.72 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  32.13 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.63 
 
 		 240 aa  132  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  37.7 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.83 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  32.08 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.58 
 
 		 227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 218 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.72 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  36.92 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32.39 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  34.26 
 
 		 214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.82 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.88 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.84 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  30.09 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  34.72 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  34.72 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.29 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  33.86 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.22 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.49 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.25 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.6 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.58 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.27 
 
 		 214 aa  98.2  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.03 
 
 		 212 aa  97.1  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.72 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  42.06 
 
 		 148 aa  95.1  7e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.75 
 
 		 239 aa  94.7  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  28.24 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.97 
 
 		 134 aa  90.9  1e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  28.02 
 
 		 336 aa  90.5  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  28.49 
 
 		 236 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  39.02 
 
 		 134 aa  88.2  9e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  38.21 
 
 		 134 aa  86.7  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  38.21 
 
 		 134 aa  85.9  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.65 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  27.91 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.22 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.74 
 
 		 232 aa  82  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.85 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 234 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.98 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.37 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.89 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  32.62 
 
 		 227 aa  75.5  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.83 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  27.23 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  32.33 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  24.89 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  26.75 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  27.31 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.93 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.11 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  27.16 
 
 		 229 aa  72  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  31.11 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.54 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.2 
 
 		 230 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>