189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30780 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  465  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  74.04 
 
 		 229 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  67.23 
 
 		 234 aa  306  1.0000000000000001e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  66.95 
 
 		 240 aa  306  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  68.94 
 
 		 236 aa  305  5.0000000000000004e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  65.4 
 
 		 244 aa  279  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.13 
 
 		 231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  62.18 
 
 		 228 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  64.26 
 
 		 238 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  61.11 
 
 		 231 aa  266  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  60.76 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  56.36 
 
 		 230 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  56.36 
 
 		 230 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  56.36 
 
 		 230 aa  245  3e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  59.48 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  55.93 
 
 		 229 aa  241  7e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.3 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  53.81 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.8 
 
 		 227 aa  238  9e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  55.19 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  55.08 
 
 		 230 aa  237  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.67 
 
 		 229 aa  235  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  55.65 
 
 		 229 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  55.13 
 
 		 234 aa  234  1.0000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.51 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  59.62 
 
 		 231 aa  231  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  54.39 
 
 		 236 aa  228  9e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  54.89 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  55.32 
 
 		 232 aa  224  9e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  55.56 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.79 
 
 		 228 aa  221  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.77 
 
 		 233 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  58.99 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  54.87 
 
 		 239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  49.26 
 
 		 246 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  49.01 
 
 		 254 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.59 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  33.49 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.09 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  31.51 
 
 		 236 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.6 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.18 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  36.02 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.11 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  37.9 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.26 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.63 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  30.51 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 		 214 aa  94.4  2e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.91 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  32.27 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.36 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.8 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.77 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.09 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.2 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.35 
 
 		 240 aa  89.4  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.55 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.5 
 
 		 232 aa  89  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  40.62 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  30.64 
 
 		 228 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.26 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.92 
 
 		 238 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.9 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  36.7 
 
 		 251 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  29.18 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  29.18 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  29.18 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.59 
 
 		 237 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  30.6 
 
 		 237 aa  84  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  39.53 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.26 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  30.28 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  35.56 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.51 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.94 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  29.02 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.84 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  29.18 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.44 
 
 		 149 aa  79  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 232 aa  78.6  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  30.4 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  30.34 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.87 
 
 		 239 aa  78.2  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.96 
 
 		 240 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.57 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  39.23 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  27.85 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  32.28 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  32.28 
 
 		 134 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  29.2 
 
 		 215 aa  76.6  0.0000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  32.82 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  33.07 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  31.5 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  34.09 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.66 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>