255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1391 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 238 aa  465  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  55.93 
 
 		 242 aa  265  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  55.37 
 
 		 248 aa  265  5.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  55.17 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  55.17 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  55.17 
 
 		 240 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  58.77 
 
 		 230 aa  255  4e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  53.39 
 
 		 228 aa  248  8e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  51.97 
 
 		 224 aa  235  3e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.84 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.49 
 
 		 232 aa  230  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  54.42 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  50.23 
 
 		 240 aa  224  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.13 
 
 		 237 aa  222  4e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  52.14 
 
 		 251 aa  219  3.9999999999999997e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  49.56 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.5 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  57.63 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.03 
 
 		 233 aa  202  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  47.16 
 
 		 229 aa  196  3e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  47.03 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  46.77 
 
 		 227 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.75 
 
 		 227 aa  158  6e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.39 
 
 		 235 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  42.25 
 
 		 223 aa  155  4e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  37.38 
 
 		 218 aa  155  7e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.81 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.9 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  39.66 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.2 
 
 		 220 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  45.16 
 
 		 237 aa  148  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 235 aa  145  5e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.39 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  43.01 
 
 		 230 aa  145  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  33.65 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  38.03 
 
 		 226 aa  144  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.3 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.94 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  40 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  35.29 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  35.36 
 
 		 218 aa  139  6e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.63 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.09 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.22 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  35.78 
 
 		 220 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.46 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.99 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  40.89 
 
 		 221 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.44 
 
 		 214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  31.55 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.26 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.64 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.5 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.29 
 
 		 239 aa  106  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  29.17 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  35.9 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.62 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.86 
 
 		 161 aa  102  7e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  34.92 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  35.45 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  37.25 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.55 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.24 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  33.33 
 
 		 214 aa  99.4  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  33 
 
 		 231 aa  99  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  33.83 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  33.83 
 
 		 214 aa  99  6e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.37 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.54 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  36.76 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  34.1 
 
 		 255 aa  97.1  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.97 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.05 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.61 
 
 		 214 aa  95.5  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  31.53 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.5 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.55 
 
 		 238 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  32.71 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  35.03 
 
 		 310 aa  93.2  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  35.12 
 
 		 215 aa  92.4  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  32.34 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  32.34 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  32.34 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  32.51 
 
 		 228 aa  90.9  1e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  38.35 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 239 aa  90.9  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  32.24 
 
 		 229 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  32.82 
 
 		 230 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  39.1 
 
 		 244 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.16 
 
 		 233 aa  89.4  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  34.62 
 
 		 134 aa  89  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.4 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.03 
 
 		 235 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>