247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0933 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  100 
 
 
217 aa  440  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.28 
 
 
216 aa  263  1e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  56.28 
 
 
218 aa  247  9e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  55.81 
 
 
217 aa  246  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.09 
 
 
218 aa  244  4.9999999999999997e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.02 
 
 
220 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  49.3 
 
 
220 aa  228  6e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.08 
 
 
221 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  48.37 
 
 
235 aa  211  7e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  50 
 
 
220 aa  208  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  44.5 
 
 
229 aa  176  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  40.47 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  41.79 
 
 
240 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  41.79 
 
 
240 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  41.79 
 
 
240 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.37 
 
 
233 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.34 
 
 
232 aa  170  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  40.7 
 
 
240 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  40.38 
 
 
237 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  36.53 
 
 
234 aa  165  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  40.69 
 
 
248 aa  165  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  40.31 
 
 
227 aa  165  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.97 
 
 
237 aa  164  9e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  37.86 
 
 
242 aa  162  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  39.34 
 
 
218 aa  161  7e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.91 
 
 
240 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  38.21 
 
 
228 aa  158  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  34.76 
 
 
251 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 
235 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  36.11 
 
 
227 aa  149  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.15 
 
 
230 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  35.68 
 
 
237 aa  146  3e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.62 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.18 
 
 
226 aa  145  6e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.86 
 
 
232 aa  144  9e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.65 
 
 
238 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.62 
 
 
227 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  36.11 
 
 
226 aa  143  2e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.7 
 
 
223 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  34.92 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.34 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  34.8 
 
 
224 aa  139  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.16 
 
 
234 aa  138  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.41 
 
 
229 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.56 
 
 
218 aa  135  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.55 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  37.7 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  36.87 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.55 
 
 
225 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  34.72 
 
 
221 aa  130  1.0000000000000001e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 
236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35.27 
 
 
239 aa  129  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 
240 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  41.09 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  33.18 
 
 
215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.39 
 
 
219 aa  113  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32.39 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.88 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.24 
 
 
214 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.07 
 
 
239 aa  101  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.31 
 
 
227 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  34.29 
 
 
221 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.16 
 
 
239 aa  99  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  28.3 
 
 
236 aa  98.2  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  33.33 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  33.33 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  37.6 
 
 
148 aa  93.2  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  27.83 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  35.16 
 
 
234 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  27.62 
 
 
213 aa  89.4  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  29.25 
 
 
250 aa  89.4  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  37.01 
 
 
255 aa  88.2  9e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  31.42 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  35.25 
 
 
134 aa  87.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  36.43 
 
 
234 aa  86.7  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  32.71 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  27.7 
 
 
270 aa  86.7  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.59 
 
 
237 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.78 
 
 
212 aa  85.1  7e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  34.43 
 
 
134 aa  85.1  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  34.43 
 
 
134 aa  85.1  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.81 
 
 
247 aa  84.7  9e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.44 
 
 
224 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 
227 aa  84  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.11 
 
 
234 aa  83.6  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  35.66 
 
 
231 aa  83.2  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.96 
 
 
231 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  35.16 
 
 
230 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.39 
 
 
239 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.43 
 
 
161 aa  81.6  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.43 
 
 
232 aa  81.6  0.000000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  36.43 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  36.43 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  36.43 
 
 
230 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  28.8 
 
 
229 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.01 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.11 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.67 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.38 
 
 
134 aa  79  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  34.88 
 
 
229 aa  78.6  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>