288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3986 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  100 
 
 		 237 aa  476  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  91.44 
 
 		 230 aa  418  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.6 
 
 		 235 aa  224  6e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  51.4 
 
 		 223 aa  207  8e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.07 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  47.64 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  50.25 
 
 		 221 aa  182  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  48.47 
 
 		 248 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  46.08 
 
 		 242 aa  177  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  41.67 
 
 		 218 aa  175  7e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.29 
 
 		 218 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.25 
 
 		 240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  45.59 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  45.59 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  45.59 
 
 		 240 aa  172  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  44.06 
 
 		 240 aa  172  5e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  48.79 
 
 		 239 aa  171  5.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.84 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  49.75 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  44.95 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  39.23 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.36 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.72 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  164  8e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  39.63 
 
 		 237 aa  164  8e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.2 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.83 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.79 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  43.35 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  41.01 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.36 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.4 
 
 		 227 aa  159  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.56 
 
 		 232 aa  156  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.19 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.9 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.23 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.56 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.15 
 
 		 229 aa  152  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  42.35 
 
 		 230 aa  151  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  37.77 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  40.28 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  42.36 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  39.17 
 
 		 226 aa  148  6e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.16 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.68 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.69 
 
 		 221 aa  145  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.15 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.32 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  40.44 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.28 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  35.47 
 
 		 220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.28 
 
 		 227 aa  130  3e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  33.84 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  37.82 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  34.72 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.06 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.91 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  31.94 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 		 212 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  35.53 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.19 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  33.62 
 
 		 231 aa  110  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  34.63 
 
 		 230 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32.28 
 
 		 222 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  31.46 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  36.47 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.56 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.85 
 
 		 232 aa  105  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  34.34 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.2 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  29.58 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  31.96 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.6 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  41.67 
 
 		 134 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  32.56 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  41.67 
 
 		 134 aa  102  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  41.67 
 
 		 134 aa  102  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  31.34 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  41.67 
 
 		 148 aa  99.8  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  32.21 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  32 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  32 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  32 
 
 		 230 aa  99.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  32.04 
 
 		 244 aa  99.4  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  32.14 
 
 		 229 aa  99  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  32.64 
 
 		 255 aa  98.6  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 		 233 aa  98.2  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  34.05 
 
 		 336 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  30.96 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.09 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  30.96 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 229 aa  96.3  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.81 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.41 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  32.38 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  27.05 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.09 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.73 
 
 		 224 aa  92.8  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>