177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4512 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  100 
 
 		 336 aa  662    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  34.23 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  34.05 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  35.86 
 
 		 230 aa  97.1  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.89 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  29.83 
 
 		 217 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  27.12 
 
 		 235 aa  92.4  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  37.58 
 
 		 441 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 441 aa  90.1  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  32.81 
 
 		 227 aa  88.6  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  32.46 
 
 		 230 aa  86.7  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  32.62 
 
 		 222 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29 
 
 		 240 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  30.05 
 
 		 223 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.13 
 
 		 229 aa  86.3  8e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.2 
 
 		 235 aa  84.7  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.64 
 
 		 233 aa  84  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  33.1 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.61 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  32.61 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  23.19 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.67 
 
 		 227 aa  82.4  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.98 
 
 		 237 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.85 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.71 
 
 		 240 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  30.43 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  30 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  34.64 
 
 		 221 aa  79  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  30.98 
 
 		 228 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  26.92 
 
 		 220 aa  78.6  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  32.04 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.89 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.02 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.16 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  30.73 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  30.73 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  30.73 
 
 		 240 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  31.76 
 
 		 428 aa  75.9  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.07 
 
 		 232 aa  75.5  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 		 232 aa  75.9  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  26.32 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.46 
 
 		 239 aa  75.9  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.88 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  31.38 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  32.4 
 
 		 225 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.61 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.7 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  26.16 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.1 
 
 		 225 aa  71.6  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.19 
 
 		 218 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.32 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  30.28 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.32 
 
 		 227 aa  69.7  0.00000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  29.93 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.84 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.84 
 
 		 225 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 240 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.63 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.32 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.21 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.98 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.88 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  26.42 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  36.19 
 
 		 447 aa  64.3  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  24.53 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  38.71 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.62 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.29 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.95 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.15 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.71 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  25.76 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.91 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.85 
 
 		 247 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25 
 
 		 214 aa  62  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.41 
 
 		 239 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.3 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  37.11 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  39.13 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  27.04 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.85 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.13 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  24.76 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.71 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.86 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  31.28 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  28.83 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02720  Ferrous iron transport protein FeoA  40.85 
 
 		 73 aa  58.9  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  24.78 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2718  FeoA family protein  37.66 
 
 		 89 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641042  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  37.74 
 
 		 231 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  36.52 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1382  iron-dependent repressor, putative  28.17 
 
 		 214 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.813037  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  35.54 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>