More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2147 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  100 
 
 		 466 aa  944    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  39.95 
 
 		 428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  40.43 
 
 		 415 aa  302  1e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  44.26 
 
 		 351 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  38.19 
 
 		 299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  40.42 
 
 		 307 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  38.62 
 
 		 314 aa  212  1e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  36.24 
 
 		 370 aa  211  3e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  39.29 
 
 		 306 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  37.15 
 
 		 421 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  40.64 
 
 		 307 aa  206  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  41.57 
 
 		 293 aa  203  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  40.15 
 
 		 295 aa  198  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  36.49 
 
 		 297 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  31.06 
 
 		 400 aa  182  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  41.2 
 
 		 377 aa  179  1e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  36.47 
 
 		 409 aa  172  9e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  41.11 
 
 		 304 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  31.41 
 
 		 399 aa  170  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  37.71 
 
 		 355 aa  167  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  30.11 
 
 		 292 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  26.76 
 
 		 447 aa  158  2e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  40.8 
 
 		 385 aa  156  9e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  28.87 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  28.23 
 
 		 458 aa  153  5.9999999999999996e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 277 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.36 
 
 		 285 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.44 
 
 		 296 aa  147  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.07 
 
 		 279 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.08 
 
 		 304 aa  136  7.000000000000001e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.83 
 
 		 280 aa  136  9e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.94 
 
 		 288 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  28.41 
 
 		 441 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 289 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.94 
 
 		 288 aa  128  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  30.89 
 
 		 293 aa  128  3e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.87 
 
 		 281 aa  123  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  33.22 
 
 		 286 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  28.22 
 
 		 441 aa  123  8e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.87 
 
 		 286 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.87 
 
 		 286 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.87 
 
 		 286 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.87 
 
 		 286 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 278 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 278 aa  120  6e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  32.21 
 
 		 290 aa  120  7e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.84 
 
 		 300 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 278 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 278 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  30.52 
 
 		 312 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 278 aa  118  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.94 
 
 		 288 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.94 
 
 		 288 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  28.81 
 
 		 287 aa  117  6e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.66 
 
 		 290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.69 
 
 		 280 aa  116  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.66 
 
 		 290 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  32.62 
 
 		 285 aa  116  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  31.95 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 287 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  29 
 
 		 277 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.67 
 
 		 289 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 294 aa  113  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 286 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  30.65 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  33.82 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  34.18 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  30.94 
 
 		 288 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  32.58 
 
 		 290 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  32.41 
 
 		 285 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.29 
 
 		 294 aa  110  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  30.97 
 
 		 276 aa  110  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  34.21 
 
 		 280 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2146  hypothetical protein  28.94 
 
 		 295 aa  108  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  26.99 
 
 		 386 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  31.9 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  32.23 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  31.85 
 
 		 286 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  31.88 
 
 		 312 aa  106  8e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  31.85 
 
 		 286 aa  106  8e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  31.12 
 
 		 285 aa  106  9e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  27.65 
 
 		 292 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 286 aa  106  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  31.43 
 
 		 291 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  30.45 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  32.72 
 
 		 286 aa  105  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  29.68 
 
 		 286 aa  104  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1973  ABC transporter, membrane protein  30.17 
 
 		 293 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  28.37 
 
 		 285 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  28.78 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.69 
 
 		 272 aa  102  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 278 aa  100  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0654  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 284 aa  100  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  30.96 
 
 		 286 aa  100  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  25.59 
 
 		 368 aa  99.8  9e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  31.25 
 
 		 289 aa  99.8  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 297 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.62 
 
 		 297 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0033  ABC-3 protein  25.77 
 
 		 367 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.042942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>