225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1222 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  42.79 
 
 		 235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  37.38 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  34.84 
 
 		 222 aa  143  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.87 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.81 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.75 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  31.16 
 
 		 228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  33.86 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  32.99 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  32.99 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  32.99 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  31.79 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  31.79 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  32.04 
 
 		 224 aa  122  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.84 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  32.23 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  33.94 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.56 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.85 
 
 		 226 aa  118  9e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  34.7 
 
 		 220 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  41.98 
 
 		 223 aa  116  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.92 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.49 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.5 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  34.24 
 
 		 251 aa  113  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  37.57 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.67 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  31.94 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  35.93 
 
 		 227 aa  111  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.77 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.19 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  32.39 
 
 		 217 aa  111  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.73 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  32.28 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  32.39 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.11 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.85 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  33.52 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  34.27 
 
 		 214 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.77 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.95 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  33.02 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  32.8 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.3 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.31 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  32.4 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.54 
 
 		 236 aa  101  7e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 240 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  33.96 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  33.96 
 
 		 214 aa  100  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.31 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  43.65 
 
 		 134 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  42.86 
 
 		 134 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  43.65 
 
 		 134 aa  99.4  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.94 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  32.9 
 
 		 217 aa  95.1  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  40.15 
 
 		 148 aa  95.1  8e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.69 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.52 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  30.95 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.1 
 
 		 219 aa  90.1  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  29.33 
 
 		 215 aa  89.7  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.12 
 
 		 214 aa  88.6  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.09 
 
 		 161 aa  86.7  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.8 
 
 		 214 aa  85.9  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.47 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  45.38 
 
 		 127 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.01 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  32.26 
 
 		 237 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.27 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  34.21 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.88 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.32 
 
 		 149 aa  77.8  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  39.39 
 
 		 441 aa  76.3  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.92 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.03 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  38.38 
 
 		 441 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.58 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  32.52 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.49 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4277  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4108  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3946  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3957  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.295063  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4333  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4428  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4224  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.56 
 
 		 236 aa  68.9  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4057  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2897  manganese transport transcriptional regulator  33.93 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000708107  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4314  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  34.88 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  30.28 
 
 		 254 aa  68.2  0.00000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0920  manganese transport transcriptional regulator  31.97 
 
 		 142 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  30.63 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  33.59 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  21.13 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>