275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33150 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  446  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  53.74 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  53.92 
 
 		 237 aa  223  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.51 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.6 
 
 		 237 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.13 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  51.02 
 
 		 240 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  50.78 
 
 		 251 aa  194  7e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  48.62 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  48.56 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  48.56 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  48.56 
 
 		 240 aa  192  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  46.79 
 
 		 234 aa  191  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  46.15 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.47 
 
 		 232 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  47.93 
 
 		 228 aa  188  8e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  49.23 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.41 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.74 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.09 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  42.73 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  41.44 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  42.99 
 
 		 227 aa  170  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  45.41 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  40.31 
 
 		 217 aa  165  6.9999999999999995e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  40.91 
 
 		 237 aa  164  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.77 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.35 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.33 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.44 
 
 		 216 aa  154  8e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  41.9 
 
 		 226 aa  152  5e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.33 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  40.91 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.27 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  44.17 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  36.45 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.42 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  38.78 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.87 
 
 		 236 aa  145  7.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.61 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.51 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.84 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  40.2 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  40.7 
 
 		 220 aa  141  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  39.47 
 
 		 224 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.05 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  37.31 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.25 
 
 		 232 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.44 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  33.96 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.55 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  39.11 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  39.47 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  39.47 
 
 		 214 aa  125  6e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  36.61 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  38.95 
 
 		 214 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  31.35 
 
 		 215 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  37.05 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.67 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  44.36 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.35 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  35.93 
 
 		 222 aa  111  7.000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.65 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  37.84 
 
 		 229 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  35.96 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  37.9 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  36.77 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  36.77 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  36.77 
 
 		 230 aa  108  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  37.38 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.71 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.67 
 
 		 239 aa  105  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  41.61 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.51 
 
 		 247 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.51 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  42.31 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  32.86 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  37.96 
 
 		 148 aa  102  5e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  44.62 
 
 		 255 aa  101  9e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.93 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.54 
 
 		 233 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  40.74 
 
 		 234 aa  98.2  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  42.31 
 
 		 236 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.69 
 
 		 161 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.36 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.53 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.77 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  42.97 
 
 		 246 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  37.65 
 
 		 310 aa  95.5  6e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.47 
 
 		 224 aa  95.5  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  43.31 
 
 		 254 aa  95.1  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  37.31 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.95 
 
 		 212 aa  94  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.13 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  35.66 
 
 		 134 aa  93.2  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  34.52 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>