175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0424 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  100 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  81.2 
 
 		 246 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  48.86 
 
 		 231 aa  199  5e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  45.89 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.22 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.24 
 
 		 234 aa  188  5.999999999999999e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.24 
 
 		 235 aa  188  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.19 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  50.5 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  49.13 
 
 		 228 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  46.52 
 
 		 234 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.78 
 
 		 231 aa  182  4.0000000000000006e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  44.3 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  46.34 
 
 		 244 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  44.16 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  44.16 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  44.16 
 
 		 230 aa  180  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  48.26 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  44.59 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  49.01 
 
 		 236 aa  178  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.02 
 
 		 232 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  45.22 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.61 
 
 		 227 aa  177  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  46.57 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  43.48 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  49.49 
 
 		 240 aa  175  8e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.78 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  47.42 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  43.86 
 
 		 229 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.1 
 
 		 228 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  43.53 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  47.67 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.4 
 
 		 238 aa  166  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  40.34 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  43.52 
 
 		 239 aa  159  6e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.65 
 
 		 247 aa  111  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.51 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.64 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  32.51 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.89 
 
 		 232 aa  96.3  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  43.31 
 
 		 227 aa  95.1  9e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.68 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 239 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  39.57 
 
 		 240 aa  91.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  29.29 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.41 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  37.21 
 
 		 221 aa  86.7  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  34.55 
 
 		 229 aa  86.7  4e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.27 
 
 		 227 aa  85.9  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.71 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.99 
 
 		 238 aa  85.5  8e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.21 
 
 		 237 aa  85.5  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.82 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  39.52 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.32 
 
 		 241 aa  82.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.41 
 
 		 225 aa  82.4  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  38.35 
 
 		 248 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.48 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  37.8 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  37.8 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  37.8 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  29.13 
 
 		 230 aa  81.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  31.77 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  36.84 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.73 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  29.29 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  33.03 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  36.02 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.15 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  28.97 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  38.58 
 
 		 221 aa  78.2  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.04 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.63 
 
 		 229 aa  78.2  0.0000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.04 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.23 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.62 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  34.15 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.77 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.77 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  33.07 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  33.58 
 
 		 234 aa  75.5  0.0000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  33.59 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  35.48 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  29.63 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  38.06 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.37 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.5 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  31.5 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.14 
 
 		 218 aa  72  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.94 
 
 		 234 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  28.32 
 
 		 219 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  30.71 
 
 		 134 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.29 
 
 		 149 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  31.3 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.82 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>