187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4546 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 228 aa  460  1e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  71.17 
 
 		 232 aa  304  6e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  70.27 
 
 		 232 aa  299  2e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60 
 
 		 229 aa  258  8e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.95 
 
 		 231 aa  246  1e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.52 
 
 		 230 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  55.95 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  58.59 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  62.38 
 
 		 231 aa  237  9e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  62.31 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.51 
 
 		 234 aa  235  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  54.42 
 
 		 244 aa  234  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.27 
 
 		 238 aa  234  7e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.39 
 
 		 235 aa  234  7e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  55.26 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.34 
 
 		 227 aa  230  1e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  60 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  60 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  60 
 
 		 230 aa  229  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  60.8 
 
 		 229 aa  228  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  56.36 
 
 		 240 aa  226  2e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  60.91 
 
 		 230 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  53.98 
 
 		 229 aa  223  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.11 
 
 		 233 aa  222  3e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  52.79 
 
 		 236 aa  221  6e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  54.67 
 
 		 234 aa  221  6e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  51.3 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  52.23 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.58 
 
 		 232 aa  218  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  54.63 
 
 		 255 aa  218  7e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.97 
 
 		 236 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  54.59 
 
 		 241 aa  216  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.69 
 
 		 240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  52.8 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  43.1 
 
 		 254 aa  173  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  46.53 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31 
 
 		 247 aa  115  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.58 
 
 		 224 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  33.95 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  31.63 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.37 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  32.28 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  37.98 
 
 		 221 aa  97.4  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  30.85 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.62 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  39.84 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.57 
 
 		 226 aa  90.9  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  31.08 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.41 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  32.16 
 
 		 230 aa  90.1  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  36.36 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  36.36 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  36.36 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.57 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.2 
 
 		 241 aa  87.4  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.47 
 
 		 226 aa  87.4  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.29 
 
 		 212 aa  85.5  6e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.48 
 
 		 237 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.32 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.84 
 
 		 234 aa  85.1  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.32 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.62 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.53 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.83 
 
 		 242 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  33.83 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.32 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.88 
 
 		 218 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.38 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  32 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.44 
 
 		 232 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  28.87 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.91 
 
 		 227 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  32.81 
 
 		 237 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  32.03 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  27.55 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.99 
 
 		 216 aa  79  0.00000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.38 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.58 
 
 		 240 aa  79  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.2 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.42 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  30.94 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.25 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  30.97 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.69 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  32.8 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  33.59 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 240 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  29.6 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  29.6 
 
 		 134 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  32.07 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  23.91 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  29.6 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  34.68 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.36 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.95 
 
 		 235 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  30.47 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.97 
 
 		 236 aa  72  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  30.94 
 
 		 225 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>