192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3790 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  67.97 
 
 		 230 aa  285  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  65.92 
 
 		 231 aa  273  1.0000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60 
 
 		 228 aa  258  8e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.16 
 
 		 227 aa  253  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  60.35 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  61.23 
 
 		 227 aa  249  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  67.19 
 
 		 235 aa  249  2e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  61.23 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  59.57 
 
 		 231 aa  248  5e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  59.03 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  59.03 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  59.03 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.74 
 
 		 238 aa  246  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  58.15 
 
 		 230 aa  245  4e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  59.47 
 
 		 229 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.83 
 
 		 231 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.33 
 
 		 233 aa  241  6e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.5 
 
 		 234 aa  240  1e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  65.28 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.44 
 
 		 229 aa  236  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  56.67 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63.73 
 
 		 232 aa  235  4e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.32 
 
 		 236 aa  234  9e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  63.4 
 
 		 244 aa  233  1.0000000000000001e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  62.44 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.46 
 
 		 240 aa  231  6e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  60.1 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  63.13 
 
 		 234 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  61.93 
 
 		 232 aa  227  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  60 
 
 		 240 aa  224  8e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  63.35 
 
 		 255 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  56.4 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  53.24 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  48 
 
 		 254 aa  194  7e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  46.88 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.34 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  36.92 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  36.45 
 
 		 236 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.62 
 
 		 247 aa  105  5e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  34.56 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  31.77 
 
 		 230 aa  99.4  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.11 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.11 
 
 		 225 aa  99  6e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  37.5 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  38.36 
 
 		 224 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  40.77 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.52 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  35.88 
 
 		 225 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  32.81 
 
 		 213 aa  95.9  4e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.46 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  37.21 
 
 		 221 aa  95.5  6e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.77 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.25 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.64 
 
 		 232 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.67 
 
 		 220 aa  93.2  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.9 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  37.24 
 
 		 230 aa  91.7  9e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.55 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.74 
 
 		 214 aa  90.5  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.72 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40 
 
 		 218 aa  89.4  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 241 aa  89.4  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  34.13 
 
 		 223 aa  88.6  7e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  38.17 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  30.21 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  41.54 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.14 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.7 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  29.74 
 
 		 242 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34.81 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34.81 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34.81 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.46 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  35.46 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.67 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 248 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  29.13 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.88 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  30.05 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.6 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  38.1 
 
 		 251 aa  79.7  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.82 
 
 		 237 aa  79.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.56 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.22 
 
 		 227 aa  77  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.65 
 
 		 234 aa  77  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  27.54 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  31.78 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.27 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.81 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  33.08 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.09 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.88 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.28 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>