244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2024 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  56.28 
 
 		 217 aa  247  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.08 
 
 		 220 aa  244  6e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  52.78 
 
 		 216 aa  235  3e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  52.78 
 
 		 217 aa  228  6e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  50.92 
 
 		 218 aa  226  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  49.3 
 
 		 220 aa  225  4e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  51.16 
 
 		 221 aa  223  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  47.25 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  43.78 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.67 
 
 		 233 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  40.64 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  36.28 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  41.01 
 
 		 237 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  39.63 
 
 		 230 aa  155  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.14 
 
 		 235 aa  154  9e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  38.32 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.56 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.45 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  37.21 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  34.1 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  38.89 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  36.55 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  36.55 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  36.55 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.36 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.26 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  34.85 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.25 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  38.43 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  33.66 
 
 		 228 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.36 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  33.8 
 
 		 237 aa  138  6e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.11 
 
 		 240 aa  138  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.09 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.84 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  36.99 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.99 
 
 		 232 aa  135  4e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.02 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.36 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  35.38 
 
 		 230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  31.43 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  37.77 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  32.83 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.19 
 
 		 234 aa  131  9e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  35.78 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  39.9 
 
 		 239 aa  129  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.93 
 
 		 240 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.84 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.65 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.12 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.76 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  33.94 
 
 		 222 aa  119  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.58 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  37.5 
 
 		 217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  33.8 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.19 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.17 
 
 		 239 aa  108  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.79 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.96 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  31.65 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.43 
 
 		 214 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  32.26 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  32.26 
 
 		 214 aa  96.7  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.23 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  33.18 
 
 		 214 aa  95.5  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  27.78 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.95 
 
 		 229 aa  90.1  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  28.86 
 
 		 213 aa  90.1  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  25.55 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  35.88 
 
 		 148 aa  87.8  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.14 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  35.16 
 
 		 134 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  28.96 
 
 		 250 aa  85.5  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  29.39 
 
 		 229 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.27 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.32 
 
 		 227 aa  85.1  8e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.8 
 
 		 240 aa  84.7  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  34.38 
 
 		 134 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  30.56 
 
 		 270 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  34.38 
 
 		 134 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.05 
 
 		 212 aa  83.2  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  28.82 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.01 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.85 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  28.95 
 
 		 229 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.82 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  27.31 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  33.05 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  27.31 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.59 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  27.31 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  26.5 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  29.23 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  35.11 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.26 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.15 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.13 
 
 		 236 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  27.75 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>