214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0550 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  100 
 
 		 270 aa  543  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  77.73 
 
 		 250 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  72.8 
 
 		 234 aa  330  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  34.41 
 
 		 220 aa  96.7  3e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.05 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.97 
 
 		 220 aa  91.3  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.65 
 
 		 221 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  35.48 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  27.7 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.76 
 
 		 240 aa  85.9  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  35 
 
 		 148 aa  85.9  7e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  30.56 
 
 		 218 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  27.14 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  29.77 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  34.17 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  34.17 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  34.17 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.49 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.05 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.96 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.27 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.91 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  28.17 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  29.33 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  34.24 
 
 		 251 aa  78.6  0.00000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.85 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.27 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.61 
 
 		 176 aa  77  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.24 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.3 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.82 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  36.94 
 
 		 218 aa  75.1  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  35.2 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  30.61 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.72 
 
 		 242 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.91 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.22 
 
 		 240 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  34.16 
 
 		 227 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  31.58 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  31.58 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.13 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  39.33 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  25.84 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.88 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  36.15 
 
 		 144 aa  72.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.52 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  32 
 
 		 220 aa  72  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  32.92 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  34.84 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.43 
 
 		 232 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  30.94 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.89 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.33 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.72 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.87 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  29.69 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.41 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.12 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.34 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.43 
 
 		 126 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  31.28 
 
 		 230 aa  67.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.9 
 
 		 143 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  37.93 
 
 		 140 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.9 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.27 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  39.83 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.86 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.89 
 
 		 241 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  27.2 
 
 		 127 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2677  manganese transport regulator MntR  34.71 
 
 		 149 aa  64.3  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0464566  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.56 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  27.32 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  37.01 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.5 
 
 		 146 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.65 
 
 		 143 aa  61.6  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.23 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  30.32 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1555  manganese transport regulator MntR  32.09 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.416104  normal  0.0630822 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  36.46 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.04 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  31.75 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  35.29 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  27.68 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.26 
 
 		 218 aa  58.5  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  58.2  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  22.32 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3400  manganese transport regulator MntR  35.65 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00918  manganese transport regulator MntR  35.29 
 
 		 155 aa  58.5  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0409262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  30 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2426  manganese transport regulator MntR  34.71 
 
 		 152 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  57  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.85 
 
 		 125 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 166 aa  57  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  33.33 
 
 		 166 aa  57  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>