198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1831 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 		 227 aa  455  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  73.57 
 
 		 227 aa  338  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  74.67 
 
 		 229 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  75 
 
 		 230 aa  334  5.999999999999999e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  74.35 
 
 		 230 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  74.35 
 
 		 230 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  74.35 
 
 		 230 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  73.8 
 
 		 229 aa  328  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.09 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  62.93 
 
 		 231 aa  274  7e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.47 
 
 		 238 aa  257  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  65.24 
 
 		 234 aa  254  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.16 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.47 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  58.62 
 
 		 228 aa  248  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.21 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.62 
 
 		 235 aa  245  4.9999999999999997e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.69 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.51 
 
 		 240 aa  238  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  56.28 
 
 		 236 aa  238  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  55.26 
 
 		 234 aa  238  8e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  57.8 
 
 		 236 aa  238  8e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  59.83 
 
 		 255 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.26 
 
 		 231 aa  235  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  61.11 
 
 		 244 aa  234  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.36 
 
 		 233 aa  234  7e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  57.89 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  55.9 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  54.51 
 
 		 241 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  58.33 
 
 		 232 aa  231  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.34 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  56.6 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  57.01 
 
 		 240 aa  215  4e-55  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  52.13 
 
 		 239 aa  210  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  42.99 
 
 		 246 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  42.61 
 
 		 254 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.92 
 
 		 247 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.63 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  38.38 
 
 		 236 aa  121  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  39.46 
 
 		 237 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.22 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.92 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.63 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  33.19 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  35.2 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  40.51 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  32.89 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.91 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  40.88 
 
 		 213 aa  101  1e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.59 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.75 
 
 		 218 aa  99  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  31.58 
 
 		 228 aa  98.2  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.13 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  32.66 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  32.66 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  32.66 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.94 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.3 
 
 		 212 aa  95.9  5e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  32.69 
 
 		 242 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  95.5  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  39.46 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.48 
 
 		 226 aa  94.7  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.66 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.17 
 
 		 248 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.64 
 
 		 221 aa  92.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  33.03 
 
 		 251 aa  92.4  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  42.31 
 
 		 222 aa  92.4  5e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.68 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.29 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  31.32 
 
 		 218 aa  91.3  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  32.47 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  36.43 
 
 		 221 aa  89.4  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.14 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  38.17 
 
 		 218 aa  88.2  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.68 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.94 
 
 		 234 aa  85.9  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.03 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.12 
 
 		 239 aa  85.5  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.32 
 
 		 218 aa  85.1  8e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.66 
 
 		 217 aa  84  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  34.88 
 
 		 217 aa  82.8  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.78 
 
 		 237 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.15 
 
 		 236 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  28.32 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  32.54 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.43 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.14 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.36 
 
 		 221 aa  79.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 		 220 aa  79.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  29.34 
 
 		 214 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.14 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.05 
 
 		 219 aa  76.6  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  30 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>