200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1008 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  100 
 
 
234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  78.11 
 
 
234 aa  362  3e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  72.46 
 
 
232 aa  324  6e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  68.8 
 
 
233 aa  308  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  67.52 
 
 
236 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  59.09 
 
 
232 aa  258  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.58 
 
 
238 aa  257  9e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  60.18 
 
 
228 aa  254  7e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  58.65 
 
 
232 aa  254  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.91 
 
 
235 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.87 
 
 
234 aa  251  8.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.16 
 
 
240 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  57.46 
 
 
227 aa  248  6e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  61.5 
 
 
230 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  61.5 
 
 
230 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  61.5 
 
 
230 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  63.5 
 
 
230 aa  248  7e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  58.52 
 
 
229 aa  246  3e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  57.64 
 
 
229 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  57.64 
 
 
241 aa  241  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.41 
 
 
229 aa  239  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.72 
 
 
230 aa  240  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.52 
 
 
236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  63 
 
 
231 aa  236  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  58.52 
 
 
255 aa  234  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  55.13 
 
 
236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.9 
 
 
227 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.26 
 
 
228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.47 
 
 
231 aa  230  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63.13 
 
 
229 aa  228  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  56.47 
 
 
231 aa  228  8e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  54.19 
 
 
244 aa  217  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  55.36 
 
 
240 aa  209  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  55.38 
 
 
239 aa  194  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  48.48 
 
 
246 aa  186  3e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  46.52 
 
 
254 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.09 
 
 
226 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.5 
 
 
224 aa  112  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.21 
 
 
225 aa  106  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  31.96 
 
 
230 aa  106  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  35.56 
 
 
227 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  41.61 
 
 
227 aa  104  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  31.96 
 
 
237 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  33.33 
 
 
236 aa  102  6e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.98 
 
 
227 aa  101  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.93 
 
 
239 aa  100  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  33.16 
 
 
237 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.72 
 
 
232 aa  99  6e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.39 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 
247 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.29 
 
 
223 aa  96.3  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.71 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34 
 
 
239 aa  95.5  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.53 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.05 
 
 
236 aa  94.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  33.85 
 
 
224 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.61 
 
 
218 aa  92.4  5e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.48 
 
 
241 aa  92.4  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.95 
 
 
234 aa  92  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  37.8 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  37.8 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  37.8 
 
 
240 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  39.06 
 
 
229 aa  90.9  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.51 
 
 
221 aa  90.1  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.31 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  37.31 
 
 
240 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.16 
 
 
217 aa  89.7  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  37.8 
 
 
228 aa  89.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.38 
 
 
216 aa  88.6  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.94 
 
 
237 aa  88.6  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  36.36 
 
 
230 aa  88.2  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.58 
 
 
218 aa  87  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 
227 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  29.65 
 
 
213 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
229 aa  87.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  41.54 
 
 
222 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.35 
 
 
239 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  35.88 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  40.38 
 
 
239 aa  86.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  30.53 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  32.51 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  36.22 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 
232 aa  85.5  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.66 
 
 
226 aa  85.1  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  36.22 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.35 
 
 
212 aa  84  0.000000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.67 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  27.07 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.16 
 
 
234 aa  82.8  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.38 
 
 
235 aa  81.6  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  32.67 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  26.5 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.66 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.27 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  33.33 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  30.8 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  41.35 
 
 
251 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  29.92 
 
 
134 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>