192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2235 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  74.78 
 
 		 230 aa  342  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  73.57 
 
 		 227 aa  338  4e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  73.48 
 
 		 230 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  73.48 
 
 		 230 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  73.48 
 
 		 230 aa  335  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  73.36 
 
 		 229 aa  333  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  73.8 
 
 		 229 aa  331  5e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  68.02 
 
 		 231 aa  268  4e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.3 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.95 
 
 		 235 aa  260  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  60.26 
 
 		 228 aa  259  4e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.83 
 
 		 233 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.01 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.29 
 
 		 236 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.78 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  61.61 
 
 		 232 aa  252  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  61.23 
 
 		 229 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.65 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  57.46 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.55 
 
 		 234 aa  248  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  56.03 
 
 		 241 aa  244  6.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  55.41 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  59.82 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  56.33 
 
 		 234 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  58.33 
 
 		 231 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  57.89 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.59 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.65 
 
 		 240 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  61.62 
 
 		 244 aa  238  8e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  66.67 
 
 		 255 aa  237  9e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  55.19 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  64.77 
 
 		 240 aa  225  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  50.47 
 
 		 239 aa  204  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  43.48 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  45.58 
 
 		 246 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  38.95 
 
 		 236 aa  124  8.000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  41.08 
 
 		 237 aa  122  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  34.06 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 		 247 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.29 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.59 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  37.05 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  35.53 
 
 		 237 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.91 
 
 		 214 aa  113  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.86 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  36.22 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.67 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.9 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.63 
 
 		 237 aa  104  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.16 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  32.62 
 
 		 223 aa  99  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.39 
 
 		 226 aa  95.5  5e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.17 
 
 		 235 aa  95.9  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  32.13 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  30.26 
 
 		 240 aa  94.7  9e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.68 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.2 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.25 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  41.41 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  38.24 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32 
 
 		 225 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  30.81 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  30.81 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  30.81 
 
 		 240 aa  91.7  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.6 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  30.04 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  33.85 
 
 		 234 aa  90.9  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  28.38 
 
 		 228 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  33.51 
 
 		 230 aa  89.4  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  30.28 
 
 		 242 aa  89  5e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.97 
 
 		 221 aa  89.4  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.81 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.94 
 
 		 241 aa  88.2  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.25 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  31.42 
 
 		 217 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  30.81 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  41.86 
 
 		 222 aa  87  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  29.94 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3680  DtxR family iron dependent repressor  26.84 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.361063  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.71 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  35 
 
 		 251 aa  85.9  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 227 aa  85.5  7e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.46 
 
 		 220 aa  85.1  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  31.7 
 
 		 221 aa  84.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  28.82 
 
 		 218 aa  84  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.66 
 
 		 221 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.1 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.16 
 
 		 237 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0775  DtxR family iron dependent repressor  31.29 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0343924  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.46 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2623  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.11 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 237 aa  82  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.65 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.78 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.93 
 
 		 229 aa  81.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1590  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.55 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.3687  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.49 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00437401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>