188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0794 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  100 
 
 
231 aa  458  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  89.57 
 
 
231 aa  411  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63.76 
 
 
236 aa  282  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  63.76 
 
 
229 aa  279  3e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  62.98 
 
 
234 aa  271  6e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  61.11 
 
 
236 aa  266  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.48 
 
 
230 aa  257  9e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  59.83 
 
 
241 aa  255  3e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.17 
 
 
240 aa  254  7e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  60.25 
 
 
238 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  58.95 
 
 
235 aa  249  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  59.57 
 
 
229 aa  248  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  58.33 
 
 
227 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  62.38 
 
 
231 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0779  iron dependent repressor  58.08 
 
 
228 aa  241  9e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  55.95 
 
 
228 aa  240  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  55.7 
 
 
234 aa  234  7e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12725  iron-dependent repressor and activator ideR  56.52 
 
 
230 aa  231  5e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  56.52 
 
 
230 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2222  iron dependent repressor  56.52 
 
 
230 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  0.661172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2165  iron dependent repressor  56.52 
 
 
230 aa  230  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248278  hitchhiker  0.0016948 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  55.95 
 
 
232 aa  230  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  56.52 
 
 
244 aa  231  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0249  iron dependent repressor  55.36 
 
 
236 aa  230  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.612567  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.77 
 
 
233 aa  229  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2450  iron dependent repressor  56.52 
 
 
229 aa  229  4e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  56.77 
 
 
232 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.6 
 
 
227 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  56.47 
 
 
234 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  56.77 
 
 
232 aa  226  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3949  iron dependent repressor  55.46 
 
 
229 aa  225  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  58.26 
 
 
255 aa  223  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04190  Mn-dependent transcriptional regulator  58.45 
 
 
240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09110  Mn-dependent transcriptional regulator  54.67 
 
 
239 aa  212  2.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.357041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  45.45 
 
 
246 aa  178  4.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  45.22 
 
 
254 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.5 
 
 
224 aa  119  6e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  33.64 
 
 
237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.62 
 
 
237 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.72 
 
 
236 aa  108  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.62 
 
 
226 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.89 
 
 
247 aa  107  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  33.62 
 
 
230 aa  106  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.75 
 
 
214 aa  105  6e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.13 
 
 
237 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.66 
 
 
239 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.19 
 
 
225 aa  97.4  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.13 
 
 
212 aa  96.7  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  39.55 
 
 
213 aa  96.7  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.62 
 
 
218 aa  95.5  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  39.52 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  32.56 
 
 
224 aa  92  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.22 
 
 
232 aa  91.3  1e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 
226 aa  91.7  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  34.38 
 
 
227 aa  90.5  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.91 
 
 
241 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  38.76 
 
 
221 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  35.08 
 
 
248 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34.92 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34.92 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34.92 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  42.19 
 
 
229 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.2 
 
 
236 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  34.21 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.3 
 
 
232 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  34.55 
 
 
240 aa  85.1  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  35.12 
 
 
239 aa  85.1  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.82 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.72 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.88 
 
 
229 aa  84  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  39.23 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  30.2 
 
 
234 aa  83.2  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.44 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.95 
 
 
234 aa  82  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  38.76 
 
 
227 aa  82  0.000000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 
227 aa  81.6  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1950  iron repressor, putative  34.64 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2248  iron dependent repressor  29.53 
 
 
224 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.757251  normal  0.319996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.09 
 
 
238 aa  80.5  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  36.36 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2385  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.34 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.86 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2297  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.34 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.29738  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  27.75 
 
 
218 aa  79.7  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.9 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  31.72 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  36.17 
 
 
218 aa  78.2  0.00000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.06 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.78 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1566  Iron (metal) dependent repressor  28.65 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.43 
 
 
235 aa  76.6  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  33.33 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.82 
 
 
239 aa  76.6  0.0000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  25.91 
 
 
215 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  26.67 
 
 
235 aa  75.1  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  31.2 
 
 
134 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  34.11 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  30 
 
 
226 aa  74.7  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  26.64 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.05 
 
 
240 aa  74.7  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>