278 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2241 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  100 
 
 		 226 aa  465  9.999999999999999e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  45.25 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  41.36 
 
 		 222 aa  162  5.0000000000000005e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  46.33 
 
 		 227 aa  161  8.000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  38.01 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  47.49 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  41.74 
 
 		 240 aa  158  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.37 
 
 		 226 aa  154  8e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  39.73 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  41.01 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  37.38 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  41.9 
 
 		 227 aa  152  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  47.22 
 
 		 229 aa  150  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.18 
 
 		 227 aa  150  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  39.17 
 
 		 237 aa  148  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.24 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  37.56 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.08 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.53 
 
 		 235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  41.85 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  39.38 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  37.56 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  38.2 
 
 		 242 aa  145  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.24 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  39.81 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.03 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  36.11 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  39.01 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.73 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.57 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  39.18 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  40.09 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.7 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  36.16 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  36.16 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  36.16 
 
 		 240 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.29 
 
 		 229 aa  138  7.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  36.99 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  37.79 
 
 		 251 aa  134  8e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  39.29 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  37.64 
 
 		 220 aa  133  3e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.64 
 
 		 232 aa  132  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.31 
 
 		 236 aa  132  3e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.56 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  38.42 
 
 		 229 aa  129  4.0000000000000003e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.53 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.13 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  41.4 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.98 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.66 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.1 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  37.44 
 
 		 221 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.22 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.42 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  32.08 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  41.67 
 
 		 148 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  40.91 
 
 		 134 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  40.91 
 
 		 134 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  40.15 
 
 		 134 aa  107  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.49 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  38.42 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  38.42 
 
 		 214 aa  105  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 219 aa  99  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  30.37 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  37.29 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  30.84 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  32.95 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.84 
 
 		 212 aa  92.8  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.41 
 
 		 237 aa  90.9  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.59 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  28.91 
 
 		 215 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.41 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.73 
 
 		 247 aa  89.4  4e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  30.7 
 
 		 213 aa  88.6  8e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.8 
 
 		 239 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.04 
 
 		 224 aa  86.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  30.53 
 
 		 234 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3304  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.16 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000325293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  30.85 
 
 		 234 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.98 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.87 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.79 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3553  iron dependent repressor  30.46 
 
 		 244 aa  77  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827525  normal  0.67078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  32.77 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.3 
 
 		 231 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.13 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  30 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  28.72 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.72 
 
 		 230 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  30.77 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_002950  PG1044  iron dependent repressor, putative  32.28 
 
 		 310 aa  72.8  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156073 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.58 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  32.58 
 
 		 255 aa  72  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0171  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.75 
 
 		 146 aa  70.9  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.87 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  35.48 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  33.85 
 
 		 236 aa  71.6  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2176  DtxR family iron dependent repressor  31.54 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>