284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0588 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  100 
 
 		 221 aa  450  1.0000000000000001e-126  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  46.88 
 
 		 226 aa  188  5.999999999999999e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.17 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  48.03 
 
 		 134 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  37.85 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  47.24 
 
 		 134 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  47.24 
 
 		 134 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.14 
 
 		 214 aa  125  7e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  44.88 
 
 		 148 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  35.24 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  36.61 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  37.44 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.35 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.43 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.45 
 
 		 233 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.33 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  30.84 
 
 		 234 aa  114  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.74 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  31.08 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.72 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.56 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.18 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  33.8 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.55 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.31 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  36.13 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.39 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  34.43 
 
 		 240 aa  108  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.56 
 
 		 229 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.27 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.6 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.88 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  32.56 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.8 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  32.87 
 
 		 229 aa  104  8e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.22 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  32.57 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.41 
 
 		 226 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.91 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  32.56 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.73 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.59 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.44 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.62 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  29.3 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  35.9 
 
 		 230 aa  102  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.83 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  35.32 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  35.32 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  35.32 
 
 		 240 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.8 
 
 		 230 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  32.56 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1472  iron dependent repressor  44.74 
 
 		 127 aa  102  6e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.797934  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.5 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  34.02 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  41.09 
 
 		 222 aa  99.8  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  34.29 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.87 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  30.6 
 
 		 236 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1456  iron dependent repressor  29.91 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.534251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.98 
 
 		 228 aa  97.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.98 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  35.9 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  36.5 
 
 		 223 aa  97.1  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  30.19 
 
 		 221 aa  96.7  2e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.7 
 
 		 232 aa  97.4  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  35.33 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.94 
 
 		 231 aa  96.3  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1414  DtxR family iron dependent repressor  37.98 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.254441  hitchhiker  0.0000129939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0191  DtxR family iron dependent repressor  30.7 
 
 		 255 aa  96.3  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.131259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  36.72 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 		 229 aa  95.5  5e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  32.86 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8780  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.74 
 
 		 238 aa  95.5  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.706534 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.9 
 
 		 237 aa  95.1  7e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  29.33 
 
 		 238 aa  95.1  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.4 
 
 		 236 aa  95.1  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  33.51 
 
 		 242 aa  95.1  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.95 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  36.72 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.98 
 
 		 149 aa  93.2  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24030  Mn-dependent transcriptional regulator  31.74 
 
 		 241 aa  92  6e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  34.18 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.89 
 
 		 247 aa  91.7  8e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  34.18 
 
 		 214 aa  91.7  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  29.67 
 
 		 210 aa  91.7  9e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.65 
 
 		 231 aa  90.5  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  30.95 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  31.78 
 
 		 235 aa  90.1  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.33 
 
 		 209 aa  90.5  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.89 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3566  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.43 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.488896  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  38.76 
 
 		 231 aa  89.7  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  39.02 
 
 		 140 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1831  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.43 
 
 		 227 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.403988  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4167  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.88 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.8 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  37.21 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.4 
 
 		 168 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.641152 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>