More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0633 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1549  iron dependent repressor  56.49 
 
 
160 aa  177  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.168929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0097  iron dependent repressor, putative  37.77 
 
 
238 aa  161  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.0071213  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0541  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.26 
 
 
207 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000508383  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0572  DtxR family iron dependent repressor  29.96 
 
 
223 aa  118  7e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1950  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.79 
 
 
168 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.641152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0525  DtxR family iron dependent repressor  48.21 
 
 
140 aa  108  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00120371  normal  0.358538 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3768  DtxR family iron dependent repressor  37.24 
 
 
177 aa  106  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000422778  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.53 
 
 
239 aa  105  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1620  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.86 
 
 
176 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.303579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2490  iron dependent repressor  40.15 
 
 
140 aa  100  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  32.86 
 
 
224 aa  100  3e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  31.94 
 
 
221 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2473  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.1 
 
 
153 aa  95.5  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0985085  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0973  iron dependent repressor  37.12 
 
 
142 aa  95.1  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0171137 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0107  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.89 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000388915  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3607  DtxR family iron dependent repressor  32.41 
 
 
225 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.155422 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0114  iron-dependent transcriptional regulator  43.86 
 
 
139 aa  92.4  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.272637  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  30.45 
 
 
226 aa  91.3  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2328  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.09 
 
 
160 aa  90.1  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0776  iron dependent repressor  34.01 
 
 
163 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3776  iron dependent repressor  39.02 
 
 
137 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259389  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0466  iron dependent repressor  27.49 
 
 
210 aa  88.6  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.514615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.87 
 
 
235 aa  88.6  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1294  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.2 
 
 
142 aa  87.8  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0620  DtxR family iron dependent repressor  41.07 
 
 
130 aa  87.8  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000404291  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0246  transcriptional regulator, MarR family  40.18 
 
 
133 aa  85.9  5e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.966628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.19 
 
 
237 aa  85.1  9e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  35.2 
 
 
134 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  35.2 
 
 
134 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2011  manganese transport transcriptional regulator  40.56 
 
 
143 aa  84  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20030  Mn-dependent transcriptional regulator  37.07 
 
 
144 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.487475 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1581  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.36 
 
 
125 aa  83.6  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000557484  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1132  DtxR family iron dependent repressor  32 
 
 
160 aa  84  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.179229 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.83 
 
 
226 aa  83.6  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  34.68 
 
 
134 aa  84  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  28.44 
 
 
230 aa  82  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0412  iron dependent repressor  35.37 
 
 
172 aa  81.6  0.000000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351504  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  35.48 
 
 
148 aa  81.6  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1191  DtxR family iron dependent repressor  41.23 
 
 
121 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.687761  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1760  transcriptional regulator, MarR family  39.5 
 
 
123 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.49 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12870  Mn-dependent transcriptional regulator  38.84 
 
 
134 aa  80.5  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0334  DtxR family iron dependent repressor  34.93 
 
 
151 aa  80.1  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000822235  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2813  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.59 
 
 
158 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.957834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.46 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1953  FeoA family protein  52.05 
 
 
80 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000394964  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  45.28 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  45.28 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1324  iron dependent repressor  34.13 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  decreased coverage  0.00365508 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02690  iron dependent repressor  35.34 
 
 
147 aa  79  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1664  DtxR family iron dependent repressor  29.37 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.4 
 
 
219 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0427  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
172 aa  78.2  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000575669  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0573  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.72 
 
 
126 aa  77.8  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0605887  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3457  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.27 
 
 
126 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300456  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2346  manganese transport transcriptional regulator  32.14 
 
 
142 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0974  FeoA family protein  59.46 
 
 
106 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0128498  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.32 
 
 
216 aa  77.4  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0343  FeoA family protein  54.79 
 
 
78 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0183501  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1450  ferrous iron transport protein A  51.39 
 
 
82 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.348854  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.77 
 
 
224 aa  77  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1535  iron-dependent transcriptional repressor  35.56 
 
 
159 aa  77.4  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.35634  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1785  FeoA family protein  29.41 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  44.34 
 
 
171 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12960  Mn-dependent transcriptional regulator  37.27 
 
 
137 aa  77.4  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.236692  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  27.23 
 
 
236 aa  76.6  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.02 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0227  manganese transport transcriptional regulator  32.14 
 
 
141 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  29.03 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4261  FeoA family protein  50 
 
 
84 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.609569  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  26.46 
 
 
217 aa  76.3  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.7 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0316  iron dependent repressor  32.88 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193805  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1619  DtxR family iron dependent repressor  42.48 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00123273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.35 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1053  DtxR family iron dependent repressor  32.82 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0113  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.95 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3292  hypothetical protein  50.7 
 
 
77 aa  75.1  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.27216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3460  FeoA family protein  48.57 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115859  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3626  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  40.5 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3941  DtxR family iron dependent repressor  41.59 
 
 
163 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.02597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4104  FeoA family protein  47.89 
 
 
77 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418864  normal  0.543833 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1457  hypothetical protein  33.79 
 
 
160 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.504372  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.43 
 
 
227 aa  73.9  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2291  manganese transport regulator MntR  39.68 
 
 
156 aa  73.9  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.466027 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.11 
 
 
236 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.55 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  27.56 
 
 
237 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22720  ferrous iron transport protein A  52.78 
 
 
75 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0987  manganese transport regulator MntR  39.47 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3367  FeoA family protein  47.22 
 
 
77 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0933  manganese transport regulator MntR  39.47 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  30.33 
 
 
218 aa  73.2  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0875  manganese transport regulator MntR  39.47 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0903  manganese transport regulator MntR  39.47 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0966  manganese transport regulator MntR  39.47 
 
 
157 aa  73.2  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0384  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  28.19 
 
 
220 aa  72.8  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  26.24 
 
 
237 aa  72.8  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>