245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1369 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  100 
 
 
217 aa  438  9.999999999999999e-123  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.86 
 
 
219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  38.86 
 
 
235 aa  131  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  40.22 
 
 
217 aa  131  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  36.95 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.21 
 
 
221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.44 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.27 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  41.09 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.38 
 
 
240 aa  125  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.57 
 
 
237 aa  123  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  34.97 
 
 
242 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  33.88 
 
 
248 aa  121  8e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  45.93 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  33.01 
 
 
228 aa  119  3e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34.04 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34.04 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34.04 
 
 
240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  37.14 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  33.64 
 
 
240 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  32.98 
 
 
230 aa  116  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.51 
 
 
226 aa  116  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.22 
 
 
232 aa  116  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  37.5 
 
 
218 aa  114  8.999999999999998e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.67 
 
 
233 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  44.36 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  41.35 
 
 
229 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  34.57 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  32.67 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  37.95 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.04 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  40.15 
 
 
237 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.8 
 
 
227 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.38 
 
 
229 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  36.47 
 
 
237 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  36.21 
 
 
230 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.44 
 
 
232 aa  105  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  29.17 
 
 
238 aa  105  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  43.88 
 
 
240 aa  104  8e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  30.94 
 
 
251 aa  104  8e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  41.41 
 
 
224 aa  103  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  31.32 
 
 
234 aa  103  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.85 
 
 
226 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  36.09 
 
 
221 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.73 
 
 
225 aa  102  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  35.15 
 
 
222 aa  102  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  33.12 
 
 
215 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.86 
 
 
235 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.42 
 
 
227 aa  99.8  3e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.31 
 
 
227 aa  99  5e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.86 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  32.9 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.31 
 
 
236 aa  95.1  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  32.95 
 
 
226 aa  93.6  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  34.98 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  34.98 
 
 
214 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  31.5 
 
 
239 aa  93.2  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.1 
 
 
234 aa  92.4  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  40 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.75 
 
 
241 aa  88.2  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.5 
 
 
134 aa  87.4  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.86 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  34.62 
 
 
134 aa  86.3  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.4 
 
 
161 aa  85.5  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.41 
 
 
239 aa  84  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  34.62 
 
 
134 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  34.62 
 
 
134 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  42.75 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  31.45 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.37 
 
 
237 aa  82  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  32.61 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  33.85 
 
 
148 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  29.33 
 
 
270 aa  78.6  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1871  iron dependent repressor  35.48 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.71 
 
 
239 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.8 
 
 
229 aa  75.1  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 
239 aa  75.1  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  38.98 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.29 
 
 
234 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2845  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.87 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0078  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.12 
 
 
149 aa  73.2  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.305356  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.29 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.64 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.6 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2926  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.74 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.172817  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6206  DtxR family iron dependent repressor  34.13 
 
 
246 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693213  normal  0.0477636 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0381  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.37 
 
 
143 aa  70.1  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0424  iron dependent repressor  34.68 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0113  DtxR family iron dependent repressor  33.87 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000348569 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  33.06 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.04 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0797  iron dependent repressor  37.19 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.62 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4272  manganese transport regulator MntR  35.78 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.405335  normal  0.994697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3596  manganese transport regulator MntR  35.78 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3888  manganese transport regulator MntR  35.78 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27510  Mn-dependent transcriptional regulator  32.8 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0837  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.6 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>