238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0463 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  100 
 
 		 220 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1365  transcriptional regulator  60.09 
 
 		 235 aa  258  6e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  50 
 
 		 217 aa  208  5e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  47.25 
 
 		 218 aa  206  1e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  46.58 
 
 		 217 aa  201  9e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.12 
 
 		 218 aa  201  9e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  45.87 
 
 		 220 aa  197  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1035  hypothetical protein  44.24 
 
 		 220 aa  196  3e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  46.89 
 
 		 216 aa  195  4.0000000000000005e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02025  putative transcriptional regulator  44.09 
 
 		 229 aa  190  1e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  44.29 
 
 		 221 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1732  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.16 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0495486  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2347  iron dependent repressor  37.44 
 
 		 248 aa  160  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.199086  hitchhiker  0.00189689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31300  Mn-dependent transcriptional regulator  38.32 
 
 		 234 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0653  DtxR family iron dependent repressor  37.9 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00367016  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  35.89 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1664  iron dependent repressor  36.99 
 
 		 229 aa  154  9e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.25936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4026  iron dependent repressor  35.1 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0873037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1173  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.74 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.990595  normal  0.0494432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  36.76 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  34.8 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2143  iron dependent repressor  34.8 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0419324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  34.8 
 
 		 240 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2117  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.04 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4031  DtxR family iron dependent repressor  38.61 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2241  iron dependent repressor  41.85 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2236  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.68 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0146641  hitchhiker  0.00566236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33150  Mn-dependent transcriptional regulator  40.7 
 
 		 227 aa  141  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.011235  normal  0.509126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0982  iron dependent repressor  39.41 
 
 		 251 aa  141  6e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0254723  normal  0.0282864 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13220  Mn-dependent transcriptional regulator  36.36 
 
 		 230 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.78 
 
 		 238 aa  136  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.00204133  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4418  DtxR family iron dependent repressor  37.97 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0904  Iron dependent repressor  35.32 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000581778  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2391  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.34 
 
 		 237 aa  134  8e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000895819 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3322  DtxR family iron dependent repressor  34.34 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.116911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2226  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.82 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2026  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.92 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.461162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1369  Mn-dependent transcriptional regulator  36.95 
 
 		 217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1279  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  42.41 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3587  DtxR family iron dependent repressor  35.64 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0941537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3986  FeoA family protein  33.84 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0657  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  41.27 
 
 		 214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.886666  normal  0.0828906 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2268  DtxR family iron dependent repressor  37.62 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0515918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2658  DtxR family iron dependent repressor  34.34 
 
 		 237 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.303372  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0687  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  39.29 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000120383  normal  0.0346372 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  35.16 
 
 		 224 aa  125  6e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1582  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.07 
 
 		 240 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.5 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2758  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.95 
 
 		 236 aa  121  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0626  DtxR family iron (metal) dependent repressor  37.95 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0317366  normal  0.280307 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2267  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.27 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4172  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.15 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.983941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0302  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.79 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.298992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1222  iron-dependent transcriptional regulator  37.57 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.47 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3572  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33 
 
 		 219 aa  105  7e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.993848  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1565  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.5 
 
 		 241 aa  104  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3281  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  34.44 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0588  iron dependent repressor  35.33 
 
 		 221 aa  97.1  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1121  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.72 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000378103  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0576  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.85 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.168469  normal  0.566228 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2016  FeoA family protein  30.28 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.15744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1534  iron-dependent transcriptional regulator  29.38 
 
 		 215 aa  88.6  7e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000830846  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0657  iron dependent repressor  34.04 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00124143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0672  iron dependent repressor  34.04 
 
 		 214 aa  88.2  8e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000655028  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0293  iron-dependent repressor  34.03 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1669  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  28.38 
 
 		 239 aa  85.9  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0962  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.56 
 
 		 161 aa  84.7  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0606985  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0258  DtxR family iron dependent repressor  40 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1567  iron dependent repressor  37.59 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0974  iron dependent repressor  39.23 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.431439  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1655  iron dependent repressor  39.23 
 
 		 134 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1726  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.05 
 
 		 212 aa  80.5  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2086  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.5 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0101  DtxR family iron dependent repressor  27.17 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4512  iron dependent repressor  26.92 
 
 		 336 aa  78.6  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0909363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0705  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  32.58 
 
 		 134 aa  77.8  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.014501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4549  iron dependent repressor  25.54 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3874  DtxR family iron dependent repressor  34.5 
 
 		 250 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000018192  normal  0.124247 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0772  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.85 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  38.24 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  33.8 
 
 		 447 aa  72.8  0.000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0550  FeoA family protein  32 
 
 		 270 aa  72  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1907  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.01 
 
 		 237 aa  72  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000908776  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30780  Mn-dependent transcriptional regulator  32.87 
 
 		 236 aa  72  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.449157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0633  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.83 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000139622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1989  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  25.76 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1008  DtxR family iron dependent repressor  32.31 
 
 		 234 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.540653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0348  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  27.45 
 
 		 247 aa  70.5  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  37.25 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0911  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.54 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.537022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5548  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  26.58 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0794  DtxR family iron dependent repressor  31.54 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.681199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3790  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  22.42 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00906262  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4546  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  30.77 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229344  normal  0.851702 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0882  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.65 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.201089 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3542  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  31.21 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0523  DtxR family iron (metal) dependent repressor  32.98 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0199964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2235  iron dependent repressor  25.79 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0647911  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1465  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  33.65 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00556833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>