More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0341 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  100 
 
 		 447 aa  901    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  26.5 
 
 		 428 aa  170  6e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1992  ABC-3 protein  29 
 
 		 458 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  26.76 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  27.79 
 
 		 415 aa  162  2e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  33.22 
 
 		 299 aa  144  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  27.34 
 
 		 351 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  30.12 
 
 		 370 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  29.8 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  28.95 
 
 		 295 aa  123  9e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  29.24 
 
 		 314 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  24.67 
 
 		 292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  26.25 
 
 		 307 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  28.1 
 
 		 293 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  28.2 
 
 		 307 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  24.03 
 
 		 400 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  28.96 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  27.89 
 
 		 377 aa  111  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.68 
 
 		 285 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  21.62 
 
 		 409 aa  108  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  25.06 
 
 		 441 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  28.76 
 
 		 297 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  24.72 
 
 		 441 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  25.08 
 
 		 280 aa  104  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  25.37 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  27.27 
 
 		 280 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  21.64 
 
 		 399 aa  96.7  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02050  zinc ABC transporter, permease protein  23.5 
 
 		 386 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  26.43 
 
 		 281 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  25.8 
 
 		 300 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  24.25 
 
 		 304 aa  92  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  25 
 
 		 385 aa  91.3  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  26.95 
 
 		 278 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  26.95 
 
 		 278 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2028  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  26.14 
 
 		 293 aa  88.2  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  26.97 
 
 		 277 aa  87  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  26.64 
 
 		 312 aa  87  6e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  26.98 
 
 		 301 aa  86.7  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  26.92 
 
 		 371 aa  86.3  9e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  24.79 
 
 		 278 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  24.71 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 288 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  26.94 
 
 		 276 aa  85.9  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  24.79 
 
 		 278 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  24.71 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  24.71 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  26.33 
 
 		 292 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  22.7 
 
 		 471 aa  82.8  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  30.94 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  24.91 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  25.18 
 
 		 277 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2957  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  38.41 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.903189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  27.99 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  23.1 
 
 		 289 aa  79.7  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1228  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.23 
 
 		 216 aa  79.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.294242  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  27.16 
 
 		 285 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0627  hypothetical protein  24.6 
 
 		 295 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  24.01 
 
 		 288 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  25.17 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1275  ABC-3 protein  25.82 
 
 		 376 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31631  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  23.44 
 
 		 279 aa  78.6  0.0000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4678  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  37.68 
 
 		 220 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.289073 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1721  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  26.32 
 
 		 281 aa  78.2  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  23.96 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2024  Mn-dependent transcriptional regulator  31.47 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  21.27 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  23.71 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  25.53 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0933  iron dependent repressor  35.51 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  25.3 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  26.24 
 
 		 337 aa  76.6  0.0000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1506  iron dependent repressor  45.74 
 
 		 224 aa  75.9  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.152976  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  24.07 
 
 		 290 aa  76.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  22.27 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  21.74 
 
 		 287 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  26.25 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  23.98 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  26.25 
 
 		 277 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6584  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.96 
 
 		 221 aa  74.7  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  27.92 
 
 		 264 aa  74.7  0.000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12801  transcriptional repressor sirR  34.29 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  24.73 
 
 		 285 aa  74.3  0.000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  25.3 
 
 		 267 aa  73.9  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  27.1 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  25.83 
 
 		 277 aa  73.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  24.72 
 
 		 266 aa  73.6  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1554  iron dependent repressor  36.96 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.662319 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  26.16 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  24.14 
 
 		 361 aa  73.2  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2160  iron dependent repressor  35.29 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.123888  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  29.02 
 
 		 264 aa  73.2  0.000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  25.42 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  25.42 
 
 		 277 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0463  iron dependent repressor  33.8 
 
 		 220 aa  72.8  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2097  DtxR family iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  25.42 
 
 		 277 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  25.86 
 
 		 277 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2080  iron dependent repressor  33.33 
 
 		 240 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.337906  normal  0.114786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>