More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3068 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  100 
 
 		 295 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  79.04 
 
 		 293 aa  434  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  58.66 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  54.79 
 
 		 370 aa  311  7.999999999999999e-84  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  58.7 
 
 		 377 aa  297  1e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  53.17 
 
 		 307 aa  293  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  50.71 
 
 		 314 aa  288  5.0000000000000004e-77  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  58.87 
 
 		 297 aa  288  1e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  49.81 
 
 		 351 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  47.39 
 
 		 307 aa  268  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  43.46 
 
 		 299 aa  258  1e-67  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  57.61 
 
 		 385 aa  242  6e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  49.82 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  56.68 
 
 		 355 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  48.57 
 
 		 421 aa  230  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  42.76 
 
 		 415 aa  224  2e-57  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  43.77 
 
 		 428 aa  223  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  40.15 
 
 		 466 aa  209  3e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  35.97 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.67 
 
 		 296 aa  185  7e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  40.88 
 
 		 400 aa  175  9e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  40.08 
 
 		 409 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  40.86 
 
 		 399 aa  159  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  31.79 
 
 		 280 aa  155  8e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  36.52 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  34.59 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  37.5 
 
 		 285 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  33.9 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  33.21 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  33.9 
 
 		 288 aa  142  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  38.11 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.65 
 
 		 280 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.39 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.39 
 
 		 278 aa  139  7e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.9 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.9 
 
 		 288 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.08 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.31 
 
 		 288 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 289 aa  133  3e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.58 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  37.74 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  32.71 
 
 		 287 aa  132  6.999999999999999e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 287 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  32.03 
 
 		 277 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  33.92 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  33.33 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  33.33 
 
 		 297 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  34.67 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.18 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  32.4 
 
 		 286 aa  126  5e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  34.43 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.81 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  34.46 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  32.73 
 
 		 285 aa  124  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  34.1 
 
 		 285 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  32.27 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  30.71 
 
 		 296 aa  122  8e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  29.04 
 
 		 447 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  32.73 
 
 		 291 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  32.14 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  36.92 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  32.51 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  37.93 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  32.14 
 
 		 294 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 286 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.77 
 
 		 286 aa  119  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  32.86 
 
 		 291 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.88 
 
 		 294 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5755  ABC-3 protein  32.74 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.365462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  32.14 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  31.41 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  32.26 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.39 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  34.32 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  28.37 
 
 		 292 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  35.66 
 
 		 275 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  30.66 
 
 		 285 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  35.66 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  30.56 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  30.85 
 
 		 285 aa  116  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  34.03 
 
 		 286 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  38.01 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 290 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  31.64 
 
 		 286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  34.56 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  35 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  37.61 
 
 		 276 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.86 
 
 		 285 aa  113  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>