More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_03370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_03370  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 		 296 aa  554  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5756  ABC-3 protein  53.1 
 
 		 421 aa  253  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.382564  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4028  ABC-3 protein  41.64 
 
 		 306 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1722  ABC-3 protein  40.97 
 
 		 293 aa  202  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0330  ATP-binding domain-containing protein  38.68 
 
 		 314 aa  190  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3068  ABC-3 protein  40.62 
 
 		 295 aa  189  4e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0170386  hitchhiker  0.00089056 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02045  zinc ABC transporter, permease protein  38.95 
 
 		 370 aa  186  4e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.976238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1400  ABC-3 protein  38.85 
 
 		 351 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0212461  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0032  ABC-3 protein  38.54 
 
 		 307 aa  176  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3555  ABC-3 protein  41.55 
 
 		 297 aa  175  7e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.105486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0623  ABC-3 protein  41.64 
 
 		 377 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00133285  normal  0.138429 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  29.58 
 
 		 307 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2147  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems permease components  34.95 
 
 		 466 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1031  hypothetical protein  33.78 
 
 		 415 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0224  ABC-3 protein  29.82 
 
 		 299 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1224  zinc ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0100  hypothetical protein  40.41 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0690  ABC-3 protein  43.37 
 
 		 385 aa  149  7e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.277403  normal  0.0173595 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2027  Mn2+/Zn2+ ABC transporter, permease  31.29 
 
 		 428 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.23567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2851  hypothetical protein  40.08 
 
 		 409 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2082  hypothetical protein  41.11 
 
 		 399 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.265611 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1276  ABC-3 protein  41.48 
 
 		 355 aa  133  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  36.7 
 
 		 312 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0703  ABC-3 protein  28.17 
 
 		 292 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000520849  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  29.56 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  29.56 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  29.79 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1993  ABC-3 protein  34.02 
 
 		 471 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  29.56 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  29.56 
 
 		 288 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.59 
 
 		 287 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.81 
 
 		 304 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.3 
 
 		 277 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  33.09 
 
 		 280 aa  119  7.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  31.63 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.3 
 
 		 287 aa  116  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.13 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  27.08 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.75 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  29.58 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  29.58 
 
 		 278 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  29.14 
 
 		 278 aa  112  7.000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 280 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  31.63 
 
 		 286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.2 
 
 		 288 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  31.52 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  33.8 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  32.85 
 
 		 294 aa  107  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5660  hypothetical protein  34.65 
 
 		 288 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.721685  normal  0.0964649 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  28.24 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  28.24 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  28.24 
 
 		 297 aa  106  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 285 aa  105  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  27.46 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  27.46 
 
 		 290 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3725  ABC-3 protein  32.13 
 
 		 441 aa  104  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3621  ABC-3 protein  32.13 
 
 		 441 aa  103  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2045  ABC-3 protein  33.04 
 
 		 278 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00377513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0331  ATP-binding domain-containing protein  28.72 
 
 		 368 aa  103  4e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1401  ABC-3 protein  29.63 
 
 		 292 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0344976  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  32.2 
 
 		 280 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  29.9 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.3 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.3 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.3 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.3 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  34.96 
 
 		 287 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  31.67 
 
 		 296 aa  101  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  29.9 
 
 		 285 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  29.3 
 
 		 286 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.5 
 
 		 286 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  30.95 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  30.24 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  30.95 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  30.42 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  31.38 
 
 		 286 aa  99.8  5e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  30.95 
 
 		 294 aa  99.4  6e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  29.63 
 
 		 285 aa  99.4  7e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  31.76 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  31.37 
 
 		 274 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  32.31 
 
 		 294 aa  97.4  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  31.1 
 
 		 274 aa  97.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  28.62 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  29.33 
 
 		 286 aa  96.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  27.3 
 
 		 277 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2783  ABC-3 protein  33.1 
 
 		 291 aa  95.5  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.314797  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0704  ABC-3 protein  26.62 
 
 		 376 aa  95.5  9e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00658505  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0341  ABC transporter, permease protein, putative  25.37 
 
 		 447 aa  95.1  1e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00122144  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  33.59 
 
 		 280 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  27.08 
 
 		 279 aa  95.5  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  32.75 
 
 		 286 aa  94.7  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  28.87 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2052  hypothetical protein  30.94 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.146645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>