More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4744 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  100 
 
 		 285 aa  559  1e-158  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  71.69 
 
 		 277 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  66.2 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  66.2 
 
 		 290 aa  345  6e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  59.09 
 
 		 281 aa  330  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  57.44 
 
 		 300 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  59.55 
 
 		 280 aa  311  6.999999999999999e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  58.27 
 
 		 278 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  58.27 
 
 		 278 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  59.42 
 
 		 297 aa  286  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1318  manganese transport system membrane protein MntB  53.62 
 
 		 283 aa  262  4.999999999999999e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  46.01 
 
 		 276 aa  243  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  45.49 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  45.56 
 
 		 288 aa  233  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  43.28 
 
 		 277 aa  226  3e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  45.56 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  45.56 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  39.86 
 
 		 280 aa  222  4.9999999999999996e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  45.49 
 
 		 288 aa  219  5e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  41.28 
 
 		 312 aa  212  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40.98 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  35.64 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  35.64 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  35.64 
 
 		 297 aa  206  3e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  40.45 
 
 		 289 aa  204  2e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  37.86 
 
 		 286 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 285 aa  203  3e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  38.38 
 
 		 304 aa  202  7e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  36.59 
 
 		 285 aa  201  9e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  36.92 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  37.45 
 
 		 285 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  36.56 
 
 		 290 aa  198  7e-50  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 294 aa  196  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  36.2 
 
 		 291 aa  195  7e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  36.4 
 
 		 275 aa  195  9e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  36.59 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  37.55 
 
 		 285 aa  193  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  36.59 
 
 		 278 aa  194  2e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  35.87 
 
 		 290 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  35.51 
 
 		 290 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  37.09 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  38.32 
 
 		 287 aa  191  9e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  35.32 
 
 		 282 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  37.16 
 
 		 285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  35.09 
 
 		 291 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  35.59 
 
 		 282 aa  189  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  35.59 
 
 		 282 aa  188  7e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  35.14 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  37 
 
 		 274 aa  187  1e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  37.93 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  35.23 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  35.23 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  35.23 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  40.36 
 
 		 306 aa  186  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  35.27 
 
 		 285 aa  185  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  38.4 
 
 		 278 aa  185  9e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  34.18 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  36.78 
 
 		 292 aa  183  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  33.45 
 
 		 285 aa  183  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  38.6 
 
 		 280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  35.36 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  34.55 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  39.34 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  35.64 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  33.82 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  36.56 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  36.92 
 
 		 290 aa  181  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  36.09 
 
 		 281 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  32.38 
 
 		 283 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  33.82 
 
 		 286 aa  177  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 287 aa  177  2e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  32.98 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  32.96 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  34.42 
 
 		 285 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  36.53 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  35.23 
 
 		 287 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.36 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.36 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.36 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.36 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  32.36 
 
 		 286 aa  172  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  32.97 
 
 		 285 aa  172  5.999999999999999e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  34.55 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  34.55 
 
 		 294 aa  172  6.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  34.34 
 
 		 304 aa  172  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  36.23 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  34.55 
 
 		 294 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  32.72 
 
 		 286 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 279 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  35.51 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  35.82 
 
 		 280 aa  169  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  31.88 
 
 		 285 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  35.97 
 
 		 279 aa  167  2e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  34.78 
 
 		 289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  31.48 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  34.43 
 
 		 299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  31.84 
 
 		 286 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  32.94 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  32.58 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>