More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3532 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  100 
 
 		 274 aa  521  1e-147  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  96.72 
 
 		 274 aa  508  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  72.32 
 
 		 272 aa  371  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  68.63 
 
 		 272 aa  360  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  67.16 
 
 		 272 aa  339  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  60.58 
 
 		 277 aa  298  5e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  59.12 
 
 		 277 aa  292  3e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  43.35 
 
 		 272 aa  195  8.000000000000001e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  39.08 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  44.18 
 
 		 280 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  35.32 
 
 		 277 aa  174  9e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  41.9 
 
 		 264 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  35.96 
 
 		 285 aa  169  5e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  35.79 
 
 		 277 aa  168  7e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  36.16 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  38.35 
 
 		 287 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  36.4 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  36.74 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  36.76 
 
 		 277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.06 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.06 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.06 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.06 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  37.3 
 
 		 266 aa  162  6e-39  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  36.65 
 
 		 272 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  36.65 
 
 		 272 aa  161  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  37.45 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  40.4 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  40.73 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  37.5 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  34.94 
 
 		 279 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  39 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  34.2 
 
 		 274 aa  158  7e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 276 aa  158  9e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  40.32 
 
 		 280 aa  157  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  38.28 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  38.52 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  34.87 
 
 		 272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  35.51 
 
 		 291 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  36.61 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  34.18 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  39.53 
 
 		 281 aa  153  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  38.52 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  37.08 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  37.84 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  35.1 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.36 
 
 		 330 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  36.61 
 
 		 326 aa  149  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  37.6 
 
 		 273 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  33.46 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  33.82 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  33.82 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.11 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  35.43 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  39.04 
 
 		 339 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  34.12 
 
 		 275 aa  146  3e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  34.94 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  34.26 
 
 		 269 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  35.43 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 269 aa  145  5e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  35.43 
 
 		 288 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  35.43 
 
 		 288 aa  145  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 291 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 277 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  35.29 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  36.4 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 279 aa  143  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18250  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.54 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  33.96 
 
 		 283 aa  142  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  34.19 
 
 		 278 aa  142  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  36.11 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  37.25 
 
 		 273 aa  142  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 		 275 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  37.16 
 
 		 280 aa  141  9.999999999999999e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  35.29 
 
 		 336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  34.49 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  36.5 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  34.22 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  34.22 
 
 		 269 aa  140  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  32.68 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 277 aa  139  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  35.38 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.12 
 
 		 270 aa  139  7e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  32.94 
 
 		 275 aa  137  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  34.87 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  31.6 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.09 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  35.83 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  34.26 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  36.73 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  33.71 
 
 		 281 aa  135  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  35.13 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  33.72 
 
 		 276 aa  135  7.000000000000001e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.94 
 
 		 268 aa  135  8e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  34.51 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>