More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0187 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  100 
 
 		 269 aa  513  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  75.77 
 
 		 272 aa  342  2.9999999999999997e-93  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  74.23 
 
 		 273 aa  337  8e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  71.11 
 
 		 273 aa  322  4e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  70.72 
 
 		 275 aa  322  5e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  73.46 
 
 		 269 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  64.31 
 
 		 273 aa  308  6.999999999999999e-83  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  64.31 
 
 		 273 aa  304  9.000000000000001e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  64.31 
 
 		 281 aa  302  4.0000000000000003e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  60.7 
 
 		 275 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  59.77 
 
 		 274 aa  289  3e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  73.41 
 
 		 273 aa  279  4e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  55.29 
 
 		 266 aa  272  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  53.28 
 
 		 272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  53.75 
 
 		 272 aa  268  8.999999999999999e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  49.81 
 
 		 277 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  51.38 
 
 		 268 aa  248  1e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  48.47 
 
 		 275 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  49.41 
 
 		 268 aa  242  5e-63  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  50.2 
 
 		 276 aa  238  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  46.33 
 
 		 279 aa  238  8e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  47.88 
 
 		 276 aa  237  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  48.44 
 
 		 273 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  55.95 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  49.59 
 
 		 274 aa  231  8.000000000000001e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  46.01 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  49.18 
 
 		 273 aa  227  1e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  52.57 
 
 		 281 aa  219  3e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 		 267 aa  218  7e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  41.83 
 
 		 269 aa  217  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  43.58 
 
 		 269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  43.68 
 
 		 267 aa  216  2.9999999999999998e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  44.06 
 
 		 267 aa  215  7e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  51.6 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  51.82 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  43.66 
 
 		 275 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  42.54 
 
 		 279 aa  199  3e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  44.58 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  39.22 
 
 		 285 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  38.49 
 
 		 277 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  44.44 
 
 		 267 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  41.15 
 
 		 287 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  36.33 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  36.51 
 
 		 264 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.87 
 
 		 274 aa  158  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.58 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  36.74 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  32.6 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 272 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 274 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  35.94 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  33.97 
 
 		 277 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  37.74 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  33.71 
 
 		 288 aa  150  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.85 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  33.97 
 
 		 288 aa  149  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  38.4 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  34.14 
 
 		 287 aa  149  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  32.97 
 
 		 277 aa  149  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  34.68 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  34.68 
 
 		 288 aa  149  6e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.11 
 
 		 272 aa  148  9e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  34.72 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  35.88 
 
 		 280 aa  148  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  32.8 
 
 		 272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  32.18 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 		 277 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  34.88 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  33.59 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  32.97 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  32.97 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  32.97 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  32.97 
 
 		 277 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  33.21 
 
 		 287 aa  144  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.3 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.92 
 
 		 330 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  34.13 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  34.9 
 
 		 291 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1230  hypothetical protein  32.68 
 
 		 301 aa  139  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  32.35 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 291 aa  137  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 277 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 281 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.87 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  29.21 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  29.21 
 
 		 278 aa  135  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  32.55 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  36.33 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  36.54 
 
 		 285 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  34.94 
 
 		 291 aa  132  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  34.08 
 
 		 289 aa  131  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  30.57 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  33.08 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>