More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1535 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  100 
 
 		 312 aa  610  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  68.79 
 
 		 310 aa  380  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  64.57 
 
 		 310 aa  336  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  63.46 
 
 		 312 aa  332  6e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  58.9 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  60.26 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  52.78 
 
 		 277 aa  260  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  47.99 
 
 		 291 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  51.31 
 
 		 300 aa  247  2e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  52.08 
 
 		 289 aa  245  6e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  49.62 
 
 		 291 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  47.1 
 
 		 337 aa  241  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  54.18 
 
 		 339 aa  219  5e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  46.45 
 
 		 283 aa  216  5.9999999999999996e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  50.52 
 
 		 301 aa  214  9.999999999999999e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  46.67 
 
 		 297 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  44.6 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  44.03 
 
 		 280 aa  182  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  35.51 
 
 		 276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  36.46 
 
 		 264 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  36.23 
 
 		 274 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  39.45 
 
 		 285 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  36.09 
 
 		 274 aa  158  9e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  37.08 
 
 		 277 aa  156  4e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  35.71 
 
 		 277 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  35.4 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  35.29 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 		 277 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  35.34 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  35.34 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  35.34 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  35.34 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  35.34 
 
 		 277 aa  152  8e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  34.96 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  36.09 
 
 		 277 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  34.57 
 
 		 284 aa  149  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  37.78 
 
 		 270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 272 aa  145  1e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  33.59 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  34.56 
 
 		 337 aa  139  4.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  34.41 
 
 		 268 aa  139  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  29.24 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  36.36 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  38.89 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  33.09 
 
 		 361 aa  136  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  30.77 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  34.49 
 
 		 279 aa  135  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 277 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  30.6 
 
 		 277 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.98 
 
 		 277 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  32.37 
 
 		 265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.85 
 
 		 281 aa  132  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  32.12 
 
 		 280 aa  132  6e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  33.08 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.14 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 290 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  32.09 
 
 		 266 aa  129  6e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  28.72 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.6 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  34.53 
 
 		 352 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 336 aa  125  8.000000000000001e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 		 273 aa  125  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  31.95 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  31.4 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  31.95 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.42 
 
 		 270 aa  124  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  32.62 
 
 		 273 aa  123  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  30.58 
 
 		 270 aa  122  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.75 
 
 		 287 aa  122  7e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  31.56 
 
 		 262 aa  122  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  34.24 
 
 		 326 aa  122  7e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  32.66 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  32.83 
 
 		 276 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  32.24 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  33.19 
 
 		 262 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.01 
 
 		 300 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  31.18 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  31.18 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  31 
 
 		 288 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  33.09 
 
 		 273 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 357 aa  119  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  31.52 
 
 		 267 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  29.64 
 
 		 275 aa  119  7.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.63 
 
 		 288 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  30.32 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  30.32 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  32.23 
 
 		 281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  28.99 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 405 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.32 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  31.84 
 
 		 262 aa  116  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1701  putative high-affinity zinc uptake system membrane protein  36.23 
 
 		 266 aa  116  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000503505  normal  0.0364016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  29.92 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 264 aa  115  6.9999999999999995e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  30.61 
 
 		 262 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.6 
 
 		 276 aa  115  7.999999999999999e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  28.97 
 
 		 285 aa  115  7.999999999999999e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>