More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04290 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 
269 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  64.18 
 
 
270 aa  328  8e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  54.51 
 
 
277 aa  258  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  44.49 
 
 
269 aa  231  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  46.44 
 
 
284 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  43.23 
 
 
268 aa  217  1e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  40.68 
 
 
266 aa  211  1e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  42.08 
 
 
264 aa  209  4e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  42.69 
 
 
264 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  37.97 
 
 
276 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  34.7 
 
 
271 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  40.7 
 
 
269 aa  176  4e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  37.59 
 
 
277 aa  171  1e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
277 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  38.69 
 
 
277 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  38.69 
 
 
277 aa  169  4e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  38.69 
 
 
277 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
277 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  38.69 
 
 
277 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  38.32 
 
 
277 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  40.44 
 
 
300 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
277 aa  166  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
277 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  37.09 
 
 
277 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  38.32 
 
 
277 aa  165  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  37.08 
 
 
269 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  37.08 
 
 
269 aa  163  3e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  39.71 
 
 
330 aa  162  6e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  35.64 
 
 
277 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  37.13 
 
 
277 aa  157  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  36.33 
 
 
289 aa  156  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  37.35 
 
 
265 aa  155  6e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  32.97 
 
 
290 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  41.77 
 
 
280 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  32.97 
 
 
290 aa  154  1e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  33.86 
 
 
282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  37.3 
 
 
326 aa  145  9e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  38.98 
 
 
285 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  34 
 
 
280 aa  143  3e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  35.38 
 
 
297 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  33.98 
 
 
291 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  34.38 
 
 
291 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  32.72 
 
 
272 aa  138  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.83 
 
 
274 aa  137  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  38.55 
 
 
339 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  36.74 
 
 
267 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  34.62 
 
 
274 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  31.54 
 
 
270 aa  133  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.89 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  31.84 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  34.96 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.48 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  33.07 
 
 
337 aa  128  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  34 
 
 
281 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  34 
 
 
280 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  30.6 
 
 
269 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  30.55 
 
 
283 aa  125  6e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  33.33 
 
 
361 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.89 
 
 
310 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.11 
 
 
278 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.11 
 
 
278 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.16 
 
 
270 aa  124  2e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.7 
 
 
308 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  30.11 
 
 
277 aa  122  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  30.52 
 
 
288 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.47 
 
 
268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  30.91 
 
 
272 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  33.33 
 
 
276 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  30.77 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  30.77 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 
288 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  36.8 
 
 
301 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  32.54 
 
 
336 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  33.57 
 
 
312 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  32.95 
 
 
310 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 
277 aa  115  6e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  34.55 
 
 
287 aa  115  7.999999999999999e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  32.27 
 
 
300 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28.83 
 
 
279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  31.78 
 
 
357 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.98 
 
 
289 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  29.62 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  31.6 
 
 
337 aa  112  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.64 
 
 
277 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  35.41 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  31.48 
 
 
278 aa  110  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  31.58 
 
 
312 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  29.21 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  29.21 
 
 
278 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  32.21 
 
 
286 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  32.62 
 
 
272 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  26.12 
 
 
275 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  31.03 
 
 
287 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  29.32 
 
 
288 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  29.78 
 
 
371 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  36.79 
 
 
312 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  32.53 
 
 
278 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  32.53 
 
 
278 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  26.97 
 
 
272 aa  106  5e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  30.04 
 
 
286 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>