More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0549 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  546  1e-154  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  57.38 
 
 		 277 aa  292  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  50.57 
 
 		 268 aa  253  3e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  46.69 
 
 		 270 aa  231  8.000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  44.65 
 
 		 276 aa  231  1e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  46.74 
 
 		 264 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  42.69 
 
 		 264 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  46.44 
 
 		 269 aa  219  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  42.64 
 
 		 269 aa  218  8.999999999999998e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  42.21 
 
 		 266 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  43.25 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  43.25 
 
 		 269 aa  209  6e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  41.76 
 
 		 277 aa  207  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  42.86 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  42.49 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  42.49 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  44.16 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 277 aa  199  5e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  42.49 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  42.49 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  42.49 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  42.49 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  42.49 
 
 		 277 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  38.66 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  42.49 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  40.43 
 
 		 280 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  41.54 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  43.03 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  39.11 
 
 		 272 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  41.03 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  41.03 
 
 		 290 aa  179  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  41.64 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  40.07 
 
 		 272 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  39.56 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  36 
 
 		 269 aa  169  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  41.6 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  36.84 
 
 		 277 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  38.02 
 
 		 326 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  35.25 
 
 		 289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  37.45 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  35.16 
 
 		 270 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  36.94 
 
 		 272 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  36.33 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.34 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  37.14 
 
 		 291 aa  157  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  36.74 
 
 		 277 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  37.7 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  39.04 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  34.36 
 
 		 361 aa  150  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.55 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  33.73 
 
 		 336 aa  147  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  37.65 
 
 		 339 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  35.34 
 
 		 337 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  34.75 
 
 		 337 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  35.43 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 268 aa  142  8e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  36.08 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  37.22 
 
 		 301 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  34.9 
 
 		 297 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  36.06 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.45 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  33.83 
 
 		 357 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  31.32 
 
 		 371 aa  132  7.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  31.6 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 289 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.46 
 
 		 310 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  31.44 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  28.68 
 
 		 280 aa  127  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4498  ABC-3 protein  34.08 
 
 		 262 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  32.8 
 
 		 262 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  32.08 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 405 aa  122  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  28.73 
 
 		 285 aa  122  9e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  30.8 
 
 		 287 aa  121  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5265  zinc ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  29.77 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  29.77 
 
 		 272 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72590  permease of ABC zinc transporter ZnuB  33.63 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  31.87 
 
 		 293 aa  119  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  33.18 
 
 		 262 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  32.96 
 
 		 310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  29.76 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  29.55 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  29.5 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  31.2 
 
 		 268 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  29.25 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  34.8 
 
 		 312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  30.62 
 
 		 276 aa  115  6.9999999999999995e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0062  hypothetical protein  31.93 
 
 		 262 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  29.86 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  31.64 
 
 		 281 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  30.8 
 
 		 269 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  28.24 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  29.04 
 
 		 280 aa  113  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.23 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  32.33 
 
 		 273 aa  112  8.000000000000001e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>