More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0129 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  100 
 
 		 269 aa  517  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  57.09 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  60.87 
 
 		 268 aa  304  1.0000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  60.87 
 
 		 268 aa  298  8e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  55.76 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  53.36 
 
 		 277 aa  281  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  53.1 
 
 		 273 aa  260  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 		 267 aa  258  8e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  48.31 
 
 		 267 aa  258  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  47.94 
 
 		 267 aa  257  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  50.56 
 
 		 269 aa  254  8e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  50.18 
 
 		 279 aa  251  6e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  50 
 
 		 272 aa  248  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  49.62 
 
 		 272 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  47.47 
 
 		 276 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  51.7 
 
 		 275 aa  239  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  51.84 
 
 		 273 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1727  ABC-3 protein  49.39 
 
 		 274 aa  233  3e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.388424 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  44.36 
 
 		 266 aa  214  9e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  47.47 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  42.91 
 
 		 275 aa  209  5e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  44.62 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  44.03 
 
 		 273 aa  199  3e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  45.7 
 
 		 273 aa  198  7.999999999999999e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  42.16 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  43.8 
 
 		 272 aa  188  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  45.53 
 
 		 275 aa  188  8e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  41.83 
 
 		 269 aa  187  1e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  44.92 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  42.7 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  43.48 
 
 		 269 aa  169  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  43.41 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3024  ABC-type transport system, permease component  45.34 
 
 		 281 aa  167  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  40.56 
 
 		 277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  45.35 
 
 		 273 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1686  ABC-3 protein  34.88 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  36.19 
 
 		 272 aa  155  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.43 
 
 		 287 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  35.21 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 277 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  33.58 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1946  ABC 3 transporter family protein  38.55 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  39.02 
 
 		 264 aa  143  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  34.2 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.99 
 
 		 274 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  32.3 
 
 		 268 aa  141  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  36.26 
 
 		 267 aa  140  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  34.07 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  30.34 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  30.34 
 
 		 278 aa  137  2e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  32.69 
 
 		 287 aa  135  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  32.08 
 
 		 281 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.58 
 
 		 279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  31.46 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  32.35 
 
 		 285 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  32.84 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  34.6 
 
 		 280 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.09 
 
 		 272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.69 
 
 		 288 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  32.96 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  31.25 
 
 		 287 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 288 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  31.6 
 
 		 300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0698  ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 293 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.499163  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 277 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.45 
 
 		 278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  35.6 
 
 		 265 aa  127  3e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  29.85 
 
 		 281 aa  126  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  32.58 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  31.35 
 
 		 272 aa  125  6e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32 
 
 		 288 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  33.46 
 
 		 280 aa  123  3e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  30.3 
 
 		 300 aa  122  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3807  ABC-3 protein  36.65 
 
 		 280 aa  121  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000100794  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  31.56 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  30.56 
 
 		 264 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  29.84 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  31.18 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  30.77 
 
 		 277 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  30.5 
 
 		 277 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  31.01 
 
 		 288 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  30.38 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  30 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  30 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  30 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  29.01 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  30 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  30 
 
 		 277 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1683  ABC-3 protein  34.1 
 
 		 265 aa  118  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>