More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2137 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  100 
 
 
277 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  63.6 
 
 
272 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  62.13 
 
 
272 aa  319  3.9999999999999996e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  60.95 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  60.58 
 
 
274 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  61.4 
 
 
272 aa  306  3e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  61.4 
 
 
277 aa  294  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  37.01 
 
 
272 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  37.01 
 
 
272 aa  175  8e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  35.56 
 
 
285 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  36.23 
 
 
280 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  38.95 
 
 
264 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  36.67 
 
 
279 aa  159  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  35.82 
 
 
272 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.33 
 
 
277 aa  155  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  36.19 
 
 
269 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  34.43 
 
 
277 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0440  ABC-3 protein  35.16 
 
 
281 aa  154  1e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000628082  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  31.64 
 
 
276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  39.45 
 
 
267 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  33.7 
 
 
277 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  32.97 
 
 
277 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  37 
 
 
281 aa  149  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  33.99 
 
 
266 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  35.42 
 
 
285 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  36.33 
 
 
277 aa  148  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  35.29 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  33.83 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  32.97 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  33.33 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  34.07 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  36.33 
 
 
280 aa  145  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  32.73 
 
 
281 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  36.02 
 
 
284 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  36.26 
 
 
287 aa  142  5e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  33.96 
 
 
361 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  32.68 
 
 
274 aa  142  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  34.19 
 
 
289 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  30.15 
 
 
275 aa  140  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  36.07 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  30.68 
 
 
272 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  30.68 
 
 
272 aa  138  7.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  33.86 
 
 
277 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  36.61 
 
 
326 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  37.3 
 
 
339 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  31.88 
 
 
281 aa  135  8e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  34.41 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  34.52 
 
 
275 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  33.99 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  35 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  30.43 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  33.2 
 
 
289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.35 
 
 
288 aa  133  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2858  ABC-3 protein  34.22 
 
 
303 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.72 
 
 
288 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  36.33 
 
 
265 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2428  high-affinity zinc transporter membrane component  34.6 
 
 
261 aa  132  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000440867  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  32.34 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  32.44 
 
 
277 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  36.15 
 
 
262 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0291  ABC transporter, permease protein  31.11 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  32.21 
 
 
289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  34.36 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  30.69 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1590  ABC-3 protein  35.29 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  35.09 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  33.83 
 
 
280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2144  high-affinity zinc transporter membrane component  34.08 
 
 
261 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0252479  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  31.35 
 
 
268 aa  130  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  33.33 
 
 
268 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  35.04 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  31.54 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  30.97 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  35.04 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  34.72 
 
 
271 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  32.34 
 
 
371 aa  129  6e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  34 
 
 
357 aa  128  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  30.95 
 
 
268 aa  128  8.000000000000001e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  32.68 
 
 
273 aa  129  8.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  32.95 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0575  hypothetical protein  36.61 
 
 
268 aa  128  9.000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  32.95 
 
 
288 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  34.65 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  31.39 
 
 
268 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  34.65 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  34.39 
 
 
261 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  34.65 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  33.45 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  34.65 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  31.64 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  34.65 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  34.65 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  34.65 
 
 
261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>