More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1580 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  100 
 
 
280 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  46.67 
 
 
264 aa  218  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  40.43 
 
 
284 aa  217  2e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  41.94 
 
 
276 aa  216  5e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  40.71 
 
 
277 aa  210  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  43.66 
 
 
277 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  45.6 
 
 
291 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  44.66 
 
 
291 aa  206  3e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  44.14 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  41.79 
 
 
277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  42.4 
 
 
272 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  40.71 
 
 
277 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  41.43 
 
 
277 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  41.43 
 
 
277 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  41.43 
 
 
277 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  41.43 
 
 
277 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  41.43 
 
 
277 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  44.58 
 
 
274 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.43 
 
 
277 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  44.58 
 
 
274 aa  195  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  41.43 
 
 
277 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  41.64 
 
 
272 aa  191  8e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  41.02 
 
 
289 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  42.05 
 
 
310 aa  189  4e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  41.48 
 
 
269 aa  189  5.999999999999999e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  42.49 
 
 
310 aa  188  8e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  39.06 
 
 
277 aa  188  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  42.8 
 
 
277 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  42.25 
 
 
283 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  40.52 
 
 
277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  43.09 
 
 
270 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  42.69 
 
 
297 aa  181  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  40.6 
 
 
337 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  44.05 
 
 
285 aa  179  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  42.53 
 
 
312 aa  175  7e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  36.92 
 
 
269 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  36.92 
 
 
269 aa  175  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  38.99 
 
 
285 aa  175  9e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  44.53 
 
 
339 aa  168  8e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  41.77 
 
 
269 aa  168  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  37.3 
 
 
268 aa  167  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  38.98 
 
 
272 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  39.08 
 
 
265 aa  167  2e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  37.83 
 
 
280 aa  165  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  37.37 
 
 
308 aa  165  6.9999999999999995e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  34.35 
 
 
279 aa  165  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  38.98 
 
 
272 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  36.59 
 
 
277 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  34.96 
 
 
266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  36.4 
 
 
290 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  39.56 
 
 
312 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  36.4 
 
 
290 aa  161  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  42.42 
 
 
301 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  39.92 
 
 
289 aa  159  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  40 
 
 
330 aa  158  9e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  40.08 
 
 
277 aa  158  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  38.43 
 
 
361 aa  157  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  35.56 
 
 
281 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  38.15 
 
 
337 aa  155  6e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  35.27 
 
 
269 aa  155  9e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  37.07 
 
 
267 aa  154  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  36.59 
 
 
275 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  33.82 
 
 
282 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  38.89 
 
 
287 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  35.69 
 
 
371 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  36.12 
 
 
280 aa  152  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  35.58 
 
 
271 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  35.29 
 
 
266 aa  152  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  34.75 
 
 
289 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  34.94 
 
 
264 aa  150  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  37.55 
 
 
300 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  33.99 
 
 
272 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  33.99 
 
 
272 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  32.59 
 
 
288 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  32.59 
 
 
288 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  31.68 
 
 
277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  34.12 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.73 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  34.12 
 
 
278 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  36.25 
 
 
336 aa  145  6e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  33.07 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  33.07 
 
 
288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  31.73 
 
 
277 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  38.55 
 
 
320 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  36.72 
 
 
273 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  33.06 
 
 
268 aa  144  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  35.63 
 
 
326 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  37.11 
 
 
273 aa  143  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  33.72 
 
 
287 aa  142  6e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3478  ABC-3 protein  35.87 
 
 
405 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  33.33 
 
 
270 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  37.25 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  32.71 
 
 
285 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  30.19 
 
 
272 aa  140  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6302  permease of ABC zinc transporter ZnuB  36.51 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2185  ABC-3 protein  41.38 
 
 
321 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0841161 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  33.33 
 
 
281 aa  139  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  35.96 
 
 
278 aa  138  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>