More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1547 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  100 
 
 		 279 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  52.63 
 
 		 267 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  40.43 
 
 		 285 aa  206  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  40.23 
 
 		 266 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  41.51 
 
 		 275 aa  199  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  40.44 
 
 		 289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1111  ABC-3 protein  38.43 
 
 		 268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  40.5 
 
 		 273 aa  193  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  39.46 
 
 		 272 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  41.57 
 
 		 273 aa  192  5e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  40.93 
 
 		 274 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0606  ABC-3 protein  40.93 
 
 		 281 aa  187  2e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  42.64 
 
 		 287 aa  185  7e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  40.75 
 
 		 276 aa  185  8e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  38.01 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  38.31 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  38.31 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  37.78 
 
 		 277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0187  ABC-3 protein  42.54 
 
 		 269 aa  182  7e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0141  ABC 3 transport family protein  46.69 
 
 		 273 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0076371  normal  0.622889 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2315  ABC-3 protein  42.12 
 
 		 272 aa  181  1e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  39.18 
 
 		 281 aa  179  4.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  37.55 
 
 		 280 aa  179  5.999999999999999e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  35.97 
 
 		 285 aa  178  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  37.17 
 
 		 289 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2474  ABC-3 protein  43.75 
 
 		 273 aa  176  3e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339421  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  36.9 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  35.4 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  36.9 
 
 		 277 aa  175  8e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  35.66 
 
 		 288 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  40.82 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  37.5 
 
 		 277 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  37.26 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1676  ABC 3 transport family protein  41.73 
 
 		 275 aa  170  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000397302  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  35.45 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  37.69 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  35.19 
 
 		 274 aa  169  4e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  36.86 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  36.82 
 
 		 275 aa  168  7e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  34.94 
 
 		 274 aa  168  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0098  cation ABC transporter, permease protein  35.86 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00199714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  35.66 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  35.66 
 
 		 288 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1256  ABC-3 protein  40.68 
 
 		 280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.400724  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  37.31 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  35.97 
 
 		 272 aa  166  4e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  35.11 
 
 		 264 aa  165  8e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  36.68 
 
 		 280 aa  165  9e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1149  ABC-3 protein  37.64 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0803  ABC-3 protein  37.22 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.117912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0776  ABC-3 protein  37.22 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4926  ABC-3 protein  35.71 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.255252  normal  0.854448 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  40.75 
 
 		 264 aa  163  3e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1013  ABC-3 protein  36.05 
 
 		 279 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  34.93 
 
 		 277 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1589  ABC-3 protein  40 
 
 		 281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  33.47 
 
 		 268 aa  162  6e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  37.55 
 
 		 276 aa  162  8.000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  35.4 
 
 		 312 aa  161  9e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  32.32 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  33.96 
 
 		 264 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  38.58 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0892  ABC-3 protein  38.58 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  35.64 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  32.36 
 
 		 276 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  34.66 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0402  ABC-3 protein  36.26 
 
 		 273 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  35.69 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.1 
 
 		 279 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  34.35 
 
 		 280 aa  157  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  36.36 
 
 		 285 aa  156  4e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  38.22 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0197  ABC-3 protein  43.36 
 
 		 269 aa  155  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.278814 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3358  hypothetical protein  37.5 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0130649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  34.67 
 
 		 330 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2210  cation ABC transporter, permease protein  39.59 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  35.42 
 
 		 285 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0117  ABC-3 protein  37.74 
 
 		 276 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.27708 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  33.57 
 
 		 304 aa  153  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0814  ABC-3 protein  39.44 
 
 		 269 aa  153  4e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0383142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  32.1 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  32.1 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  36.94 
 
 		 272 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  38.15 
 
 		 339 aa  151  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  35.4 
 
 		 281 aa  149  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  33.85 
 
 		 268 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0037  cation ABC transporter, permease protein  32.18 
 
 		 269 aa  149  7e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  33.59 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  34.77 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  34.17 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0027  ABC-3 protein  34.57 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  32.62 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  32.62 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  32.62 
 
 		 297 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  33.46 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  34.72 
 
 		 290 aa  146  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0207  ABC-3 protein  41.11 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.135711  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  31.37 
 
 		 291 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  31.11 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  35.08 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>